Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCG5

CHST4, Carbohydrate sulfotransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST4Q8NCG5 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHST4Q8NCG5 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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