Protein–RNA interactions for Protein: Q86VB7

CD163, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M130, humanhuman

Predictions only

Length 1,156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163Q86VB7 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD163Q86VB7 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CD163Q86VB7 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CD163Q86VB7 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CD163Q86VB7 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CD163Q86VB7 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CD163Q86VB7 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CD163Q86VB7 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CD163Q86VB7 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CD163Q86VB7 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CD163Q86VB7 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD163Q86VB7 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD163Q86VB7 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CD163Q86VB7 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD163Q86VB7 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD163Q86VB7 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD163Q86VB7 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD163Q86VB7 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD163Q86VB7 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD163Q86VB7 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD163Q86VB7 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms