Protein–RNA interactions for Protein: Q63HK3

ZKSCAN2, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 2, humanhuman

Predictions only

Length 967 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN2Q63HK3 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZKSCAN2Q63HK3 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZKSCAN2Q63HK3 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZKSCAN2Q63HK3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZKSCAN2Q63HK3 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZKSCAN2Q63HK3 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZKSCAN2Q63HK3 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZKSCAN2Q63HK3 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZKSCAN2Q63HK3 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZKSCAN2Q63HK3 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZKSCAN2Q63HK3 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZKSCAN2Q63HK3 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZKSCAN2Q63HK3 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZKSCAN2Q63HK3 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZKSCAN2Q63HK3 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZKSCAN2Q63HK3 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZKSCAN2Q63HK3 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZKSCAN2Q63HK3 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZKSCAN2Q63HK3 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZKSCAN2Q63HK3 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZKSCAN2Q63HK3 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ZKSCAN2Q63HK3 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ZKSCAN2Q63HK3 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZKSCAN2Q63HK3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ZKSCAN2Q63HK3 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZKSCAN2Q63HK3 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZKSCAN2Q63HK3 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZKSCAN2Q63HK3 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZKSCAN2Q63HK3 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZKSCAN2Q63HK3 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZKSCAN2Q63HK3 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZKSCAN2Q63HK3 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZKSCAN2Q63HK3 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZKSCAN2Q63HK3 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZKSCAN2Q63HK3 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZKSCAN2Q63HK3 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZKSCAN2Q63HK3 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZKSCAN2Q63HK3 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZKSCAN2Q63HK3 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ZKSCAN2Q63HK3 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZKSCAN2Q63HK3 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZKSCAN2Q63HK3 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZKSCAN2Q63HK3 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZKSCAN2Q63HK3 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZKSCAN2Q63HK3 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZKSCAN2Q63HK3 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZKSCAN2Q63HK3 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZKSCAN2Q63HK3 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZKSCAN2Q63HK3 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZKSCAN2Q63HK3 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZKSCAN2Q63HK3 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZKSCAN2Q63HK3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZKSCAN2Q63HK3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZKSCAN2Q63HK3 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZKSCAN2Q63HK3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZKSCAN2Q63HK3 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZKSCAN2Q63HK3 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZKSCAN2Q63HK3 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZKSCAN2Q63HK3 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ZKSCAN2Q63HK3 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZKSCAN2Q63HK3 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZKSCAN2Q63HK3 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZKSCAN2Q63HK3 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZKSCAN2Q63HK3 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZKSCAN2Q63HK3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZKSCAN2Q63HK3 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZKSCAN2Q63HK3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZKSCAN2Q63HK3 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZKSCAN2Q63HK3 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZKSCAN2Q63HK3 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZKSCAN2Q63HK3 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZKSCAN2Q63HK3 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZKSCAN2Q63HK3 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZKSCAN2Q63HK3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZKSCAN2Q63HK3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZKSCAN2Q63HK3 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZKSCAN2Q63HK3 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZKSCAN2Q63HK3 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZKSCAN2Q63HK3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZKSCAN2Q63HK3 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZKSCAN2Q63HK3 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZKSCAN2Q63HK3 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZKSCAN2Q63HK3 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZKSCAN2Q63HK3 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZKSCAN2Q63HK3 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ZKSCAN2Q63HK3 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZKSCAN2Q63HK3 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZKSCAN2Q63HK3 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZKSCAN2Q63HK3 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZKSCAN2Q63HK3 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZKSCAN2Q63HK3 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZKSCAN2Q63HK3 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZKSCAN2Q63HK3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZKSCAN2Q63HK3 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZKSCAN2Q63HK3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZKSCAN2Q63HK3 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZKSCAN2Q63HK3 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZKSCAN2Q63HK3 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZKSCAN2Q63HK3 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZKSCAN2Q63HK3 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms