Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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RRN3P1Q2M238 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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RRN3P1Q2M238 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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RRN3P1Q2M238 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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RRN3P1Q2M238 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RRN3P1Q2M238 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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