Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSPP1Q1MSJ5 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
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