Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCK2Q16822 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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