Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC85BQ15834 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC85BQ15834 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC85BQ15834 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC85BQ15834 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC85BQ15834 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC85BQ15834 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC85BQ15834 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC85BQ15834 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC85BQ15834 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC85BQ15834 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC85BQ15834 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC85BQ15834 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC85BQ15834 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC85BQ15834 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC85BQ15834 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC85BQ15834 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC85BQ15834 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC85BQ15834 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC85BQ15834 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC85BQ15834 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC85BQ15834 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC85BQ15834 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CCDC85BQ15834 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
CCDC85BQ15834 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CCDC85BQ15834 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CCDC85BQ15834 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
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