Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.34
LAPTM4AQ15012 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
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