Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMD6Q15008 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMD6Q15008 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMD6Q15008 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMD6Q15008 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMD6Q15008 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMD6Q15008 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMD6Q15008 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMD6Q15008 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMD6Q15008 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMD6Q15008 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMD6Q15008 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMD6Q15008 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMD6Q15008 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMD6Q15008 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMD6Q15008 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMD6Q15008 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMD6Q15008 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMD6Q15008 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMD6Q15008 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMD6Q15008 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMD6Q15008 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMD6Q15008 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMD6Q15008 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMD6Q15008 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMD6Q15008 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMD6Q15008 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMD6Q15008 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMD6Q15008 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMD6Q15008 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMD6Q15008 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMD6Q15008 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMD6Q15008 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMD6Q15008 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMD6Q15008 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMD6Q15008 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMD6Q15008 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMD6Q15008 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMD6Q15008 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMD6Q15008 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
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