Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 LDAH-202ENST00000381090 2045 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.329e-8■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 LDAH-201ENST00000237822 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.879e-8■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 LDAH-208ENST00000435420 3837 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.999e-8■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 LDAH-210ENST00000470099 2116 ntTSL 28.86□□□□□ -0.999e-8■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 LDAH-209ENST00000440866 3728 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.029e-8■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.299e-8■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.469e-8■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.389e-8■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.363e-8■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.093e-8■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.873e-8■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.713e-8■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.53e-8■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.493e-8■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.433e-8■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.143e-8■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 MRPS25-204ENST00000447299 723 ntTSL 319.91■□□□□ 0.786e-59■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 ACBD6-204ENST00000475338 964 ntTSL 512.49□□□□□ -0.412e-6■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.569e-8■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.61e-323■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.511e-323■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.481e-323■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.461e-323■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 FDPS-206ENST00000467076 1178 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 01e-323■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 FDPS-217ENST00000492244 673 ntTSL 314.56□□□□□ -0.081e-323■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 FDPS-215ENST00000490140 680 ntTSL 214.56□□□□□ -0.081e-323■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 FDPS-220ENST00000611010 1196 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.081e-323■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 FDPS-214ENST00000489324 475 ntTSL 211.52□□□□□ -0.571e-323■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.61e-6■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 FBXO18-212ENST00000481029 404 ntTSL 317.6■□□□□ 0.415e-10■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 ZNF428-203ENST00000598676 827 ntTSL 522.88■■□□□ 1.252e-6■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 NDUFS7-220ENST00000622587 802 ntTSL 522.17■■□□□ 1.144e-9■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 NDUFS7-212ENST00000540530 1707 ntTSL 220.3■□□□□ 0.844e-9■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 HBG2-202ENST00000380252 694 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.45e-9■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.285e-36■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.569e-11■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.479e-11■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 NDUFS2-203ENST00000465923 1193 ntTSL 316.71■□□□□ 0.279e-11■■■□□ 17.4
PABPC4Q13310 LNPEP-201ENST00000231368 12752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -12e-6■■■□□ 17.3
PABPC4Q13310 PFDN6-207ENST00000491382 989 ntTSL 219.21■□□□□ 0.674e-9■■■□□ 17.3
PABPC4Q13310 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.474e-9■■■□□ 17.3
PABPC4Q13310 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.485e-14■■■□□ 17.3
PABPC4Q13310 MCM4-215ENST00000523944 4105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.145e-14■■■□□ 17.3
PABPC4Q13310 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.881e-8■■■□□ 17.3
PABPC4Q13310 TTLL4-216ENST00000472527 544 ntTSL 26.1□□□□□ -1.439e-10■■■□□ 17.3
PABPC4Q13310 NT5DC2-205ENST00000463947 670 ntTSL 316.54■□□□□ 0.241e-6■■■□□ 17.3
PABPC4Q13310 PTOV1-211ENST00000598632 1073 ntTSL 225.06■■□□□ 1.61e-6■■■□□ 17.3
PABPC4Q13310 PTOV1-203ENST00000594165 986 ntTSL 322.74■■□□□ 1.231e-6■■■□□ 17.3
PABPC4Q13310 PTOV1-217ENST00000601501 564 ntTSL 219.15■□□□□ 0.661e-6■■■□□ 17.3
PABPC4Q13310 PTOV1-202ENST00000594151 995 ntTSL 517.12■□□□□ 0.331e-6■■■□□ 17.3
PABPC4Q13310 MNAT1-202ENST00000539616 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.11e-6■■■□□ 17.3
PABPC4Q13310 MNAT1-201ENST00000261245 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.241e-6■■■□□ 17.3
PABPC4Q13310 CHD7-201ENST00000423902 11568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.841e-6■■■□□ 17.3
PABPC4Q13310 MNAT1-209ENST00000557134 680 ntTSL 36.55□□□□□ -1.361e-6■■■□□ 17.3
PABPC4Q13310 MNAT1-204ENST00000554002 616 ntTSL 34.36□□□□□ -1.711e-6■■■□□ 17.3
PABPC4Q13310 QARS-205ENST00000430182 2399 ntTSL 213.71□□□□□ -0.222e-6■■■□□ 17.3
PABPC4Q13310 QARS-202ENST00000414533 2412 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.222e-6■■■□□ 17.3
PABPC4Q13310 QARS-201ENST00000306125 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.612e-6■■■□□ 17.3
PABPC4Q13310 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.822e-10■■■□□ 17.3
PABPC4Q13310 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.682e-10■■■□□ 17.3
PABPC4Q13310 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.272e-10■■■□□ 17.3
PABPC4Q13310 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.192e-7■■■□□ 17.3
PABPC4Q13310 DNAJC7-209ENST00000587727 449 ntTSL 317.56■□□□□ 0.42e-7■■■□□ 17.3
PABPC4Q13310 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.262e-7■■■□□ 17.3
PABPC4Q13310 SNHG5-209ENST00000435947 696 ntTSL 216.85■□□□□ 0.297e-13■■■□□ 17.3
PABPC4Q13310 SNHG5-206ENST00000428833 641 ntTSL 214.88□□□□□ -0.037e-13■■■□□ 17.3
PABPC4Q13310 SNHG5-210ENST00000453754 401 ntTSL 314.84□□□□□ -0.037e-13■■■□□ 17.3
PABPC4Q13310 SNHG5-219ENST00000623910 631 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.227e-13■■■□□ 17.3
PABPC4Q13310 SNHG5-221ENST00000624295 632 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.237e-13■■■□□ 17.3
PABPC4Q13310 POLG-206ENST00000526671 764 ntTSL 215.36■□□□□ 0.056e-7■■■□□ 17.3
PABPC4Q13310 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.472e-6■■■□□ 17.3
PABPC4Q13310 GPS1-206ENST00000578279 875 ntTSL 521.52■■□□□ 1.042e-7■■■□□ 17.3
PABPC4Q13310 SMU1-201ENST00000397149 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.292e-21■■■□□ 17.3
PABPC4Q13310 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.232e-25■■■□□ 17.3
PABPC4Q13310 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.22e-25■■■□□ 17.3
PABPC4Q13310 EIF4E2-204ENST00000409322 797 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.262e-25■■■□□ 17.3
PABPC4Q13310 EIF4E2-202ENST00000409098 3448 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.912e-25■■■□□ 17.3
PABPC4Q13310 EIF4E2-207ENST00000409514 3525 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.122e-25■■■□□ 17.3
PABPC4Q13310 EIF4E2-212ENST00000478878 268 ntTSL 54.94□□□□□ -1.622e-25■■■□□ 17.3
PABPC4Q13310 TRIM25-207ENST00000573108 952 ntTSL 314.82□□□□□ -0.044e-6■■■□□ 17.3
PABPC4Q13310 TRIM25-202ENST00000537230 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.134e-6■■■□□ 17.3
PABPC4Q13310 DDX46-202ENST00000452510 5689 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.582e-7■■■□□ 17.3
PABPC4Q13310 DDX46-207ENST00000507392 3565 ntTSL 29.4□□□□□ -0.92e-7■■■□□ 17.3
PABPC4Q13310 DDX46-201ENST00000354283 3821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.042e-7■■■□□ 17.3
PABPC4Q13310 DDX46-205ENST00000506332 1589 ntTSL 25.72□□□□□ -1.492e-7■■■□□ 17.3
PABPC4Q13310 DDX46-203ENST00000503946 4078 ntTSL 25.11□□□□□ -1.592e-7■■■□□ 17.3
PABPC4Q13310 DDX46-206ENST00000507053 530 ntTSL 44.75□□□□□ -1.652e-7■■■□□ 17.3
PABPC4Q13310 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.149e-10■■■□□ 17.3
PABPC4Q13310 RPL14-204ENST00000435633 966 ntTSL 226.06■■□□□ 1.761e-77■■■□□ 17.3
PABPC4Q13310 RPS3-205ENST00000525933 1307 ntTSL 512.97□□□□□ -0.332e-37■■■□□ 17.3
PABPC4Q13310 RPS3-204ENST00000525690 421 ntTSL 311.37□□□□□ -0.592e-37■■■□□ 17.3
PABPC4Q13310 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.677e-7■■■□□ 17.3
PABPC4Q13310 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.677e-7■■■□□ 17.3
PABPC4Q13310 TESC-203ENST00000470612 1057 ntTSL 223.87■■□□□ 1.417e-7■■■□□ 17.3
PABPC4Q13310 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.624e-7■■■□□ 17.3
PABPC4Q13310 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.344e-7■■■□□ 17.3
PABPC4Q13310 COPS3-215ENST00000578317 1625 ntTSL 29.23□□□□□ -0.934e-7■■■□□ 17.3
PABPC4Q13310 COPS3-203ENST00000439936 1394 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -14e-7■■■□□ 17.3
PABPC4Q13310 COPS3-216ENST00000579716 419 ntTSL 27.21□□□□□ -1.264e-7■■■□□ 17.3
PABPC4Q13310 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.443e-7■■■□□ 17.3
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