Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.33
GRIN2AQ12879 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GRIN2AQ12879 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
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