Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SRSF11Q05519 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms