Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms