Protein–RNA interactions for Protein: P42702

LIFR, Leukemia inhibitory factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIFRP42702 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LIFRP42702 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIFRP42702 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIFRP42702 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIFRP42702 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIFRP42702 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIFRP42702 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIFRP42702 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LIFRP42702 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIFRP42702 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIFRP42702 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LIFRP42702 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIFRP42702 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIFRP42702 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIFRP42702 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIFRP42702 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIFRP42702 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIFRP42702 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIFRP42702 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIFRP42702 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIFRP42702 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIFRP42702 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIFRP42702 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIFRP42702 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIFRP42702 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIFRP42702 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIFRP42702 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIFRP42702 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LIFRP42702 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIFRP42702 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIFRP42702 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIFRP42702 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIFRP42702 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIFRP42702 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIFRP42702 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LIFRP42702 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIFRP42702 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIFRP42702 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIFRP42702 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIFRP42702 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIFRP42702 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIFRP42702 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIFRP42702 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIFRP42702 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIFRP42702 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIFRP42702 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIFRP42702 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIFRP42702 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIFRP42702 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LIFRP42702 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIFRP42702 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIFRP42702 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIFRP42702 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIFRP42702 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIFRP42702 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIFRP42702 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIFRP42702 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIFRP42702 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIFRP42702 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIFRP42702 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LIFRP42702 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIFRP42702 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIFRP42702 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIFRP42702 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIFRP42702 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIFRP42702 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIFRP42702 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIFRP42702 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIFRP42702 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIFRP42702 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIFRP42702 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIFRP42702 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIFRP42702 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIFRP42702 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIFRP42702 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIFRP42702 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIFRP42702 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIFRP42702 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIFRP42702 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIFRP42702 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIFRP42702 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIFRP42702 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIFRP42702 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIFRP42702 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LIFRP42702 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIFRP42702 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIFRP42702 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIFRP42702 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIFRP42702 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIFRP42702 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LIFRP42702 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LIFRP42702 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
LIFRP42702 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LIFRP42702 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LIFRP42702 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LIFRP42702 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LIFRP42702 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIFRP42702 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIFRP42702 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LIFRP42702 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms