Protein–RNA interactions for Protein: P28335

HTR2C, 5-hydroxytryptamine receptor 2C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2CP28335 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTR2CP28335 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms