Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASKO14936 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASKO14936 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CASKO14936 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASKO14936 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASKO14936 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASKO14936 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASKO14936 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASKO14936 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASKO14936 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASKO14936 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASKO14936 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASKO14936 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASKO14936 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASKO14936 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASKO14936 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASKO14936 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASKO14936 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASKO14936 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASKO14936 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASKO14936 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASKO14936 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASKO14936 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASKO14936 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASKO14936 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CASKO14936 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASKO14936 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASKO14936 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASKO14936 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASKO14936 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASKO14936 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASKO14936 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASKO14936 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASKO14936 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASKO14936 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASKO14936 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASKO14936 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASKO14936 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASKO14936 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CASKO14936 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASKO14936 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASKO14936 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASKO14936 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASKO14936 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASKO14936 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASKO14936 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASKO14936 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASKO14936 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASKO14936 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASKO14936 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASKO14936 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASKO14936 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASKO14936 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASKO14936 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASKO14936 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASKO14936 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASKO14936 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASKO14936 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASKO14936 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASKO14936 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASKO14936 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASKO14936 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASKO14936 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASKO14936 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASKO14936 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASKO14936 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CASKO14936 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASKO14936 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASKO14936 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASKO14936 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASKO14936 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASKO14936 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASKO14936 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASKO14936 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASKO14936 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASKO14936 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASKO14936 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CASKO14936 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASKO14936 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASKO14936 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASKO14936 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASKO14936 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CASKO14936 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASKO14936 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASKO14936 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASKO14936 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASKO14936 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CASKO14936 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CASKO14936 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASKO14936 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASKO14936 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASKO14936 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASKO14936 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASKO14936 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASKO14936 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CASKO14936 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CASKO14936 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CASKO14936 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CASKO14936 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CASKO14936 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms