Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms