Protein–RNA interactions for Protein: A2RTX5

TARSL2, Probable threonine--tRNA ligase 2, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARSL2A2RTX5 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TARSL2A2RTX5 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TARSL2A2RTX5 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TARSL2A2RTX5 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TARSL2A2RTX5 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TARSL2A2RTX5 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TARSL2A2RTX5 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TARSL2A2RTX5 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TARSL2A2RTX5 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms