Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K2

SIK3, Serine/threonine-protein kinase SIK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK3Q9Y2K2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SIK3Q9Y2K2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SIK3Q9Y2K2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SIK3Q9Y2K2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SIK3Q9Y2K2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SIK3Q9Y2K2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SIK3Q9Y2K2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SIK3Q9Y2K2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SIK3Q9Y2K2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SIK3Q9Y2K2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SIK3Q9Y2K2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SIK3Q9Y2K2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SIK3Q9Y2K2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SIK3Q9Y2K2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SIK3Q9Y2K2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SIK3Q9Y2K2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SIK3Q9Y2K2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SIK3Q9Y2K2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SIK3Q9Y2K2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SIK3Q9Y2K2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SIK3Q9Y2K2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SIK3Q9Y2K2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SIK3Q9Y2K2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SIK3Q9Y2K2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SIK3Q9Y2K2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SIK3Q9Y2K2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SIK3Q9Y2K2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SIK3Q9Y2K2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SIK3Q9Y2K2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SIK3Q9Y2K2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SIK3Q9Y2K2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SIK3Q9Y2K2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SIK3Q9Y2K2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SIK3Q9Y2K2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SIK3Q9Y2K2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SIK3Q9Y2K2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SIK3Q9Y2K2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SIK3Q9Y2K2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SIK3Q9Y2K2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SIK3Q9Y2K2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SIK3Q9Y2K2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SIK3Q9Y2K2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SIK3Q9Y2K2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SIK3Q9Y2K2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SIK3Q9Y2K2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SIK3Q9Y2K2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SIK3Q9Y2K2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SIK3Q9Y2K2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SIK3Q9Y2K2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SIK3Q9Y2K2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SIK3Q9Y2K2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SIK3Q9Y2K2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SIK3Q9Y2K2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SIK3Q9Y2K2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SIK3Q9Y2K2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SIK3Q9Y2K2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SIK3Q9Y2K2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SIK3Q9Y2K2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIK3Q9Y2K2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIK3Q9Y2K2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIK3Q9Y2K2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SIK3Q9Y2K2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SIK3Q9Y2K2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SIK3Q9Y2K2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SIK3Q9Y2K2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SIK3Q9Y2K2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SIK3Q9Y2K2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SIK3Q9Y2K2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SIK3Q9Y2K2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SIK3Q9Y2K2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SIK3Q9Y2K2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SIK3Q9Y2K2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SIK3Q9Y2K2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SIK3Q9Y2K2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SIK3Q9Y2K2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SIK3Q9Y2K2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SIK3Q9Y2K2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SIK3Q9Y2K2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SIK3Q9Y2K2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SIK3Q9Y2K2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SIK3Q9Y2K2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SIK3Q9Y2K2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SIK3Q9Y2K2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SIK3Q9Y2K2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SIK3Q9Y2K2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SIK3Q9Y2K2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SIK3Q9Y2K2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SIK3Q9Y2K2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SIK3Q9Y2K2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SIK3Q9Y2K2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SIK3Q9Y2K2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SIK3Q9Y2K2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SIK3Q9Y2K2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SIK3Q9Y2K2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SIK3Q9Y2K2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SIK3Q9Y2K2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIK3Q9Y2K2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIK3Q9Y2K2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIK3Q9Y2K2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIK3Q9Y2K2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms