Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y297

BTRC, F-box/WD repeat-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BTRCQ9Y297 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BTRCQ9Y297 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BTRCQ9Y297 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BTRCQ9Y297 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BTRCQ9Y297 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BTRCQ9Y297 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BTRCQ9Y297 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BTRCQ9Y297 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
BTRCQ9Y297 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
BTRCQ9Y297 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BTRCQ9Y297 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BTRCQ9Y297 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BTRCQ9Y297 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BTRCQ9Y297 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BTRCQ9Y297 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BTRCQ9Y297 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BTRCQ9Y297 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BTRCQ9Y297 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BTRCQ9Y297 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BTRCQ9Y297 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BTRCQ9Y297 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BTRCQ9Y297 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BTRCQ9Y297 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BTRCQ9Y297 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BTRCQ9Y297 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BTRCQ9Y297 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BTRCQ9Y297 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BTRCQ9Y297 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BTRCQ9Y297 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BTRCQ9Y297 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BTRCQ9Y297 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BTRCQ9Y297 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BTRCQ9Y297 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BTRCQ9Y297 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BTRCQ9Y297 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BTRCQ9Y297 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BTRCQ9Y297 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
BTRCQ9Y297 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
BTRCQ9Y297 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BTRCQ9Y297 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BTRCQ9Y297 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BTRCQ9Y297 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BTRCQ9Y297 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BTRCQ9Y297 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BTRCQ9Y297 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BTRCQ9Y297 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BTRCQ9Y297 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BTRCQ9Y297 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BTRCQ9Y297 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BTRCQ9Y297 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BTRCQ9Y297 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BTRCQ9Y297 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BTRCQ9Y297 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BTRCQ9Y297 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BTRCQ9Y297 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BTRCQ9Y297 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BTRCQ9Y297 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BTRCQ9Y297 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BTRCQ9Y297 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BTRCQ9Y297 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BTRCQ9Y297 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BTRCQ9Y297 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BTRCQ9Y297 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BTRCQ9Y297 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BTRCQ9Y297 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BTRCQ9Y297 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BTRCQ9Y297 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BTRCQ9Y297 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BTRCQ9Y297 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BTRCQ9Y297 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
BTRCQ9Y297 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BTRCQ9Y297 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BTRCQ9Y297 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BTRCQ9Y297 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BTRCQ9Y297 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BTRCQ9Y297 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BTRCQ9Y297 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BTRCQ9Y297 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BTRCQ9Y297 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BTRCQ9Y297 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
BTRCQ9Y297 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BTRCQ9Y297 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BTRCQ9Y297 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BTRCQ9Y297 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BTRCQ9Y297 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BTRCQ9Y297 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BTRCQ9Y297 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BTRCQ9Y297 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BTRCQ9Y297 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BTRCQ9Y297 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BTRCQ9Y297 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BTRCQ9Y297 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BTRCQ9Y297 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BTRCQ9Y297 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BTRCQ9Y297 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BTRCQ9Y297 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BTRCQ9Y297 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BTRCQ9Y297 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
BTRCQ9Y297 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BTRCQ9Y297 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms