Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQQ2

SH2B3, SH2B adapter protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B3Q9UQQ2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SH2B3Q9UQQ2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SH2B3Q9UQQ2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SH2B3Q9UQQ2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH2B3Q9UQQ2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH2B3Q9UQQ2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH2B3Q9UQQ2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH2B3Q9UQQ2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH2B3Q9UQQ2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SH2B3Q9UQQ2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH2B3Q9UQQ2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH2B3Q9UQQ2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH2B3Q9UQQ2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH2B3Q9UQQ2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH2B3Q9UQQ2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH2B3Q9UQQ2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH2B3Q9UQQ2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH2B3Q9UQQ2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SH2B3Q9UQQ2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH2B3Q9UQQ2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH2B3Q9UQQ2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH2B3Q9UQQ2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH2B3Q9UQQ2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH2B3Q9UQQ2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH2B3Q9UQQ2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH2B3Q9UQQ2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH2B3Q9UQQ2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH2B3Q9UQQ2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH2B3Q9UQQ2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SH2B3Q9UQQ2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH2B3Q9UQQ2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH2B3Q9UQQ2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH2B3Q9UQQ2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH2B3Q9UQQ2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH2B3Q9UQQ2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH2B3Q9UQQ2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH2B3Q9UQQ2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH2B3Q9UQQ2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH2B3Q9UQQ2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH2B3Q9UQQ2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SH2B3Q9UQQ2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SH2B3Q9UQQ2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH2B3Q9UQQ2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH2B3Q9UQQ2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH2B3Q9UQQ2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH2B3Q9UQQ2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH2B3Q9UQQ2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH2B3Q9UQQ2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH2B3Q9UQQ2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH2B3Q9UQQ2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH2B3Q9UQQ2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH2B3Q9UQQ2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH2B3Q9UQQ2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH2B3Q9UQQ2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH2B3Q9UQQ2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH2B3Q9UQQ2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH2B3Q9UQQ2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH2B3Q9UQQ2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH2B3Q9UQQ2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH2B3Q9UQQ2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH2B3Q9UQQ2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH2B3Q9UQQ2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SH2B3Q9UQQ2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SH2B3Q9UQQ2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH2B3Q9UQQ2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH2B3Q9UQQ2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH2B3Q9UQQ2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH2B3Q9UQQ2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH2B3Q9UQQ2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH2B3Q9UQQ2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH2B3Q9UQQ2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH2B3Q9UQQ2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH2B3Q9UQQ2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH2B3Q9UQQ2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH2B3Q9UQQ2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH2B3Q9UQQ2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH2B3Q9UQQ2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SH2B3Q9UQQ2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SH2B3Q9UQQ2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SH2B3Q9UQQ2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SH2B3Q9UQQ2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SH2B3Q9UQQ2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SH2B3Q9UQQ2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SH2B3Q9UQQ2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SH2B3Q9UQQ2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH2B3Q9UQQ2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH2B3Q9UQQ2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH2B3Q9UQQ2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH2B3Q9UQQ2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH2B3Q9UQQ2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH2B3Q9UQQ2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH2B3Q9UQQ2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH2B3Q9UQQ2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH2B3Q9UQQ2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH2B3Q9UQQ2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SH2B3Q9UQQ2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SH2B3Q9UQQ2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SH2B3Q9UQQ2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SH2B3Q9UQQ2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SH2B3Q9UQQ2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms