Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULS5

TMCC3, Transmembrane and coiled-coil domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC3Q9ULS5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMCC3Q9ULS5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMCC3Q9ULS5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TMCC3Q9ULS5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMCC3Q9ULS5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMCC3Q9ULS5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMCC3Q9ULS5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMCC3Q9ULS5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMCC3Q9ULS5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMCC3Q9ULS5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCC3Q9ULS5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMCC3Q9ULS5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMCC3Q9ULS5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMCC3Q9ULS5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMCC3Q9ULS5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMCC3Q9ULS5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMCC3Q9ULS5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMCC3Q9ULS5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMCC3Q9ULS5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMCC3Q9ULS5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMCC3Q9ULS5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMCC3Q9ULS5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMCC3Q9ULS5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMCC3Q9ULS5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMCC3Q9ULS5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMCC3Q9ULS5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMCC3Q9ULS5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMCC3Q9ULS5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMCC3Q9ULS5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMCC3Q9ULS5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMCC3Q9ULS5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMCC3Q9ULS5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMCC3Q9ULS5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMCC3Q9ULS5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMCC3Q9ULS5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMCC3Q9ULS5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMCC3Q9ULS5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMCC3Q9ULS5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMCC3Q9ULS5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMCC3Q9ULS5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMCC3Q9ULS5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMCC3Q9ULS5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMCC3Q9ULS5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMCC3Q9ULS5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMCC3Q9ULS5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMCC3Q9ULS5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMCC3Q9ULS5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMCC3Q9ULS5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMCC3Q9ULS5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMCC3Q9ULS5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMCC3Q9ULS5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMCC3Q9ULS5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMCC3Q9ULS5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMCC3Q9ULS5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMCC3Q9ULS5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMCC3Q9ULS5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TMCC3Q9ULS5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMCC3Q9ULS5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMCC3Q9ULS5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMCC3Q9ULS5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMCC3Q9ULS5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMCC3Q9ULS5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMCC3Q9ULS5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMCC3Q9ULS5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TMCC3Q9ULS5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMCC3Q9ULS5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMCC3Q9ULS5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMCC3Q9ULS5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMCC3Q9ULS5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TMCC3Q9ULS5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMCC3Q9ULS5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMCC3Q9ULS5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMCC3Q9ULS5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMCC3Q9ULS5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCC3Q9ULS5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCC3Q9ULS5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCC3Q9ULS5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCC3Q9ULS5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCC3Q9ULS5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCC3Q9ULS5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMCC3Q9ULS5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMCC3Q9ULS5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMCC3Q9ULS5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TMCC3Q9ULS5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMCC3Q9ULS5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMCC3Q9ULS5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMCC3Q9ULS5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TMCC3Q9ULS5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMCC3Q9ULS5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMCC3Q9ULS5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMCC3Q9ULS5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMCC3Q9ULS5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMCC3Q9ULS5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMCC3Q9ULS5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMCC3Q9ULS5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMCC3Q9ULS5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMCC3Q9ULS5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCC3Q9ULS5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCC3Q9ULS5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCC3Q9ULS5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms