Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULP0

NDRG4, Protein NDRG4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDRG4Q9ULP0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDRG4Q9ULP0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDRG4Q9ULP0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDRG4Q9ULP0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDRG4Q9ULP0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDRG4Q9ULP0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NDRG4Q9ULP0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDRG4Q9ULP0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDRG4Q9ULP0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDRG4Q9ULP0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDRG4Q9ULP0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDRG4Q9ULP0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDRG4Q9ULP0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDRG4Q9ULP0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDRG4Q9ULP0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDRG4Q9ULP0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDRG4Q9ULP0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDRG4Q9ULP0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDRG4Q9ULP0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDRG4Q9ULP0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDRG4Q9ULP0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDRG4Q9ULP0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDRG4Q9ULP0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDRG4Q9ULP0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDRG4Q9ULP0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDRG4Q9ULP0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDRG4Q9ULP0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDRG4Q9ULP0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDRG4Q9ULP0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDRG4Q9ULP0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDRG4Q9ULP0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NDRG4Q9ULP0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDRG4Q9ULP0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDRG4Q9ULP0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDRG4Q9ULP0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDRG4Q9ULP0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDRG4Q9ULP0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDRG4Q9ULP0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDRG4Q9ULP0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDRG4Q9ULP0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDRG4Q9ULP0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDRG4Q9ULP0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NDRG4Q9ULP0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDRG4Q9ULP0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDRG4Q9ULP0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDRG4Q9ULP0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDRG4Q9ULP0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDRG4Q9ULP0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDRG4Q9ULP0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDRG4Q9ULP0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDRG4Q9ULP0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDRG4Q9ULP0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDRG4Q9ULP0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDRG4Q9ULP0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDRG4Q9ULP0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDRG4Q9ULP0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDRG4Q9ULP0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NDRG4Q9ULP0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDRG4Q9ULP0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDRG4Q9ULP0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDRG4Q9ULP0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDRG4Q9ULP0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDRG4Q9ULP0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDRG4Q9ULP0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDRG4Q9ULP0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NDRG4Q9ULP0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDRG4Q9ULP0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDRG4Q9ULP0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDRG4Q9ULP0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDRG4Q9ULP0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NDRG4Q9ULP0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDRG4Q9ULP0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDRG4Q9ULP0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDRG4Q9ULP0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDRG4Q9ULP0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDRG4Q9ULP0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDRG4Q9ULP0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDRG4Q9ULP0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDRG4Q9ULP0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDRG4Q9ULP0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDRG4Q9ULP0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDRG4Q9ULP0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NDRG4Q9ULP0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDRG4Q9ULP0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDRG4Q9ULP0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDRG4Q9ULP0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDRG4Q9ULP0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDRG4Q9ULP0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDRG4Q9ULP0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NDRG4Q9ULP0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NDRG4Q9ULP0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDRG4Q9ULP0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDRG4Q9ULP0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDRG4Q9ULP0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDRG4Q9ULP0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDRG4Q9ULP0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDRG4Q9ULP0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDRG4Q9ULP0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NDRG4Q9ULP0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDRG4Q9ULP0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms