Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKM9

RALY, RNA-binding protein Raly, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALYQ9UKM9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RALYQ9UKM9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RALYQ9UKM9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RALYQ9UKM9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RALYQ9UKM9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RALYQ9UKM9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RALYQ9UKM9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RALYQ9UKM9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RALYQ9UKM9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RALYQ9UKM9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RALYQ9UKM9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RALYQ9UKM9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RALYQ9UKM9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RALYQ9UKM9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RALYQ9UKM9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RALYQ9UKM9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RALYQ9UKM9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RALYQ9UKM9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RALYQ9UKM9 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RALYQ9UKM9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RALYQ9UKM9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RALYQ9UKM9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RALYQ9UKM9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RALYQ9UKM9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RALYQ9UKM9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RALYQ9UKM9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RALYQ9UKM9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RALYQ9UKM9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RALYQ9UKM9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RALYQ9UKM9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RALYQ9UKM9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RALYQ9UKM9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RALYQ9UKM9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RALYQ9UKM9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RALYQ9UKM9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RALYQ9UKM9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RALYQ9UKM9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RALYQ9UKM9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RALYQ9UKM9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RALYQ9UKM9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RALYQ9UKM9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RALYQ9UKM9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RALYQ9UKM9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RALYQ9UKM9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RALYQ9UKM9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RALYQ9UKM9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RALYQ9UKM9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RALYQ9UKM9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RALYQ9UKM9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RALYQ9UKM9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RALYQ9UKM9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RALYQ9UKM9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RALYQ9UKM9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RALYQ9UKM9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RALYQ9UKM9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RALYQ9UKM9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RALYQ9UKM9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RALYQ9UKM9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RALYQ9UKM9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RALYQ9UKM9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RALYQ9UKM9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RALYQ9UKM9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RALYQ9UKM9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RALYQ9UKM9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RALYQ9UKM9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RALYQ9UKM9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RALYQ9UKM9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RALYQ9UKM9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RALYQ9UKM9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RALYQ9UKM9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RALYQ9UKM9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RALYQ9UKM9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RALYQ9UKM9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RALYQ9UKM9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RALYQ9UKM9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RALYQ9UKM9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RALYQ9UKM9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RALYQ9UKM9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RALYQ9UKM9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RALYQ9UKM9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RALYQ9UKM9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RALYQ9UKM9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RALYQ9UKM9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RALYQ9UKM9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RALYQ9UKM9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RALYQ9UKM9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RALYQ9UKM9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RALYQ9UKM9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RALYQ9UKM9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RALYQ9UKM9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RALYQ9UKM9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RALYQ9UKM9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RALYQ9UKM9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RALYQ9UKM9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RALYQ9UKM9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RALYQ9UKM9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RALYQ9UKM9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RALYQ9UKM9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RALYQ9UKM9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RALYQ9UKM9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.3 ms