Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBV2

SEL1L, Protein sel-1 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEL1LQ9UBV2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SEL1LQ9UBV2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SEL1LQ9UBV2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SEL1LQ9UBV2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SEL1LQ9UBV2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SEL1LQ9UBV2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SEL1LQ9UBV2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SEL1LQ9UBV2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SEL1LQ9UBV2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SEL1LQ9UBV2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SEL1LQ9UBV2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SEL1LQ9UBV2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SEL1LQ9UBV2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SEL1LQ9UBV2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SEL1LQ9UBV2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SEL1LQ9UBV2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SEL1LQ9UBV2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SEL1LQ9UBV2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SEL1LQ9UBV2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SEL1LQ9UBV2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SEL1LQ9UBV2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SEL1LQ9UBV2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SEL1LQ9UBV2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SEL1LQ9UBV2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SEL1LQ9UBV2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SEL1LQ9UBV2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SEL1LQ9UBV2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SEL1LQ9UBV2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SEL1LQ9UBV2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SEL1LQ9UBV2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SEL1LQ9UBV2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SEL1LQ9UBV2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SEL1LQ9UBV2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
SEL1LQ9UBV2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SEL1LQ9UBV2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SEL1LQ9UBV2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SEL1LQ9UBV2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SEL1LQ9UBV2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SEL1LQ9UBV2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SEL1LQ9UBV2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SEL1LQ9UBV2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SEL1LQ9UBV2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SEL1LQ9UBV2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SEL1LQ9UBV2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SEL1LQ9UBV2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SEL1LQ9UBV2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SEL1LQ9UBV2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SEL1LQ9UBV2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SEL1LQ9UBV2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SEL1LQ9UBV2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SEL1LQ9UBV2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SEL1LQ9UBV2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SEL1LQ9UBV2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SEL1LQ9UBV2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SEL1LQ9UBV2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SEL1LQ9UBV2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SEL1LQ9UBV2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SEL1LQ9UBV2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SEL1LQ9UBV2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SEL1LQ9UBV2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SEL1LQ9UBV2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SEL1LQ9UBV2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SEL1LQ9UBV2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SEL1LQ9UBV2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SEL1LQ9UBV2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
SEL1LQ9UBV2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SEL1LQ9UBV2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SEL1LQ9UBV2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SEL1LQ9UBV2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SEL1LQ9UBV2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SEL1LQ9UBV2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SEL1LQ9UBV2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SEL1LQ9UBV2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SEL1LQ9UBV2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SEL1LQ9UBV2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SEL1LQ9UBV2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SEL1LQ9UBV2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SEL1LQ9UBV2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SEL1LQ9UBV2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SEL1LQ9UBV2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SEL1LQ9UBV2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SEL1LQ9UBV2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SEL1LQ9UBV2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SEL1LQ9UBV2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SEL1LQ9UBV2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SEL1LQ9UBV2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SEL1LQ9UBV2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SEL1LQ9UBV2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SEL1LQ9UBV2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SEL1LQ9UBV2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SEL1LQ9UBV2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SEL1LQ9UBV2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SEL1LQ9UBV2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SEL1LQ9UBV2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SEL1LQ9UBV2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SEL1LQ9UBV2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SEL1LQ9UBV2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SEL1LQ9UBV2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SEL1LQ9UBV2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SEL1LQ9UBV2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms