Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
DKK2Q9UBU2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
DKK2Q9UBU2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
DKK2Q9UBU2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
DKK2Q9UBU2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
DKK2Q9UBU2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
DKK2Q9UBU2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
DKK2Q9UBU2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
DKK2Q9UBU2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
DKK2Q9UBU2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DKK2Q9UBU2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DKK2Q9UBU2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DKK2Q9UBU2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DKK2Q9UBU2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DKK2Q9UBU2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DKK2Q9UBU2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DKK2Q9UBU2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DKK2Q9UBU2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DKK2Q9UBU2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DKK2Q9UBU2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DKK2Q9UBU2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DKK2Q9UBU2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DKK2Q9UBU2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DKK2Q9UBU2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DKK2Q9UBU2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DKK2Q9UBU2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
DKK2Q9UBU2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DKK2Q9UBU2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DKK2Q9UBU2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DKK2Q9UBU2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DKK2Q9UBU2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DKK2Q9UBU2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
DKK2Q9UBU2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
DKK2Q9UBU2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
DKK2Q9UBU2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DKK2Q9UBU2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DKK2Q9UBU2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DKK2Q9UBU2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DKK2Q9UBU2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DKK2Q9UBU2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
DKK2Q9UBU2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DKK2Q9UBU2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DKK2Q9UBU2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DKK2Q9UBU2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DKK2Q9UBU2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DKK2Q9UBU2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DKK2Q9UBU2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DKK2Q9UBU2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DKK2Q9UBU2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DKK2Q9UBU2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DKK2Q9UBU2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
DKK2Q9UBU2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DKK2Q9UBU2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DKK2Q9UBU2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DKK2Q9UBU2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DKK2Q9UBU2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DKK2Q9UBU2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DKK2Q9UBU2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DKK2Q9UBU2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DKK2Q9UBU2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DKK2Q9UBU2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DKK2Q9UBU2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DKK2Q9UBU2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DKK2Q9UBU2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DKK2Q9UBU2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DKK2Q9UBU2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DKK2Q9UBU2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DKK2Q9UBU2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DKK2Q9UBU2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DKK2Q9UBU2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DKK2Q9UBU2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DKK2Q9UBU2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DKK2Q9UBU2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DKK2Q9UBU2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DKK2Q9UBU2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DKK2Q9UBU2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DKK2Q9UBU2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DKK2Q9UBU2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DKK2Q9UBU2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DKK2Q9UBU2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DKK2Q9UBU2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DKK2Q9UBU2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DKK2Q9UBU2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DKK2Q9UBU2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DKK2Q9UBU2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DKK2Q9UBU2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DKK2Q9UBU2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DKK2Q9UBU2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DKK2Q9UBU2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DKK2Q9UBU2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DKK2Q9UBU2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DKK2Q9UBU2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DKK2Q9UBU2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DKK2Q9UBU2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DKK2Q9UBU2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DKK2Q9UBU2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DKK2Q9UBU2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DKK2Q9UBU2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DKK2Q9UBU2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DKK2Q9UBU2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms