Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBI1

COMMD3, COMM domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 195 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD3Q9UBI1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COMMD3Q9UBI1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COMMD3Q9UBI1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COMMD3Q9UBI1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COMMD3Q9UBI1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COMMD3Q9UBI1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
COMMD3Q9UBI1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COMMD3Q9UBI1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COMMD3Q9UBI1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COMMD3Q9UBI1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
COMMD3Q9UBI1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COMMD3Q9UBI1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COMMD3Q9UBI1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COMMD3Q9UBI1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COMMD3Q9UBI1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COMMD3Q9UBI1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COMMD3Q9UBI1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COMMD3Q9UBI1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
COMMD3Q9UBI1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COMMD3Q9UBI1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COMMD3Q9UBI1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COMMD3Q9UBI1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COMMD3Q9UBI1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COMMD3Q9UBI1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COMMD3Q9UBI1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COMMD3Q9UBI1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COMMD3Q9UBI1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COMMD3Q9UBI1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COMMD3Q9UBI1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COMMD3Q9UBI1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COMMD3Q9UBI1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COMMD3Q9UBI1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COMMD3Q9UBI1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COMMD3Q9UBI1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COMMD3Q9UBI1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COMMD3Q9UBI1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COMMD3Q9UBI1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COMMD3Q9UBI1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COMMD3Q9UBI1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COMMD3Q9UBI1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COMMD3Q9UBI1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COMMD3Q9UBI1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COMMD3Q9UBI1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COMMD3Q9UBI1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COMMD3Q9UBI1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COMMD3Q9UBI1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COMMD3Q9UBI1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COMMD3Q9UBI1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COMMD3Q9UBI1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COMMD3Q9UBI1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COMMD3Q9UBI1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COMMD3Q9UBI1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COMMD3Q9UBI1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COMMD3Q9UBI1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COMMD3Q9UBI1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COMMD3Q9UBI1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COMMD3Q9UBI1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COMMD3Q9UBI1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COMMD3Q9UBI1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COMMD3Q9UBI1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COMMD3Q9UBI1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COMMD3Q9UBI1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
COMMD3Q9UBI1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
COMMD3Q9UBI1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
COMMD3Q9UBI1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
COMMD3Q9UBI1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COMMD3Q9UBI1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COMMD3Q9UBI1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COMMD3Q9UBI1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COMMD3Q9UBI1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COMMD3Q9UBI1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COMMD3Q9UBI1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COMMD3Q9UBI1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COMMD3Q9UBI1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COMMD3Q9UBI1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COMMD3Q9UBI1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
COMMD3Q9UBI1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
COMMD3Q9UBI1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COMMD3Q9UBI1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COMMD3Q9UBI1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COMMD3Q9UBI1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COMMD3Q9UBI1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COMMD3Q9UBI1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COMMD3Q9UBI1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COMMD3Q9UBI1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COMMD3Q9UBI1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COMMD3Q9UBI1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COMMD3Q9UBI1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COMMD3Q9UBI1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COMMD3Q9UBI1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COMMD3Q9UBI1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COMMD3Q9UBI1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COMMD3Q9UBI1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COMMD3Q9UBI1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COMMD3Q9UBI1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COMMD3Q9UBI1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
COMMD3Q9UBI1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COMMD3Q9UBI1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COMMD3Q9UBI1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COMMD3Q9UBI1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
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