Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC5

MYO1A, Unconventional myosin-Ia, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO1AQ9UBC5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MYO1AQ9UBC5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MYO1AQ9UBC5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MYO1AQ9UBC5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MYO1AQ9UBC5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MYO1AQ9UBC5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MYO1AQ9UBC5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MYO1AQ9UBC5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MYO1AQ9UBC5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MYO1AQ9UBC5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MYO1AQ9UBC5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MYO1AQ9UBC5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MYO1AQ9UBC5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
MYO1AQ9UBC5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MYO1AQ9UBC5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MYO1AQ9UBC5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MYO1AQ9UBC5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MYO1AQ9UBC5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MYO1AQ9UBC5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MYO1AQ9UBC5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MYO1AQ9UBC5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MYO1AQ9UBC5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MYO1AQ9UBC5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MYO1AQ9UBC5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MYO1AQ9UBC5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MYO1AQ9UBC5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MYO1AQ9UBC5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MYO1AQ9UBC5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MYO1AQ9UBC5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MYO1AQ9UBC5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MYO1AQ9UBC5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MYO1AQ9UBC5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MYO1AQ9UBC5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MYO1AQ9UBC5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
MYO1AQ9UBC5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MYO1AQ9UBC5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MYO1AQ9UBC5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MYO1AQ9UBC5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MYO1AQ9UBC5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MYO1AQ9UBC5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MYO1AQ9UBC5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
MYO1AQ9UBC5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MYO1AQ9UBC5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MYO1AQ9UBC5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MYO1AQ9UBC5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MYO1AQ9UBC5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MYO1AQ9UBC5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MYO1AQ9UBC5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MYO1AQ9UBC5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MYO1AQ9UBC5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MYO1AQ9UBC5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MYO1AQ9UBC5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MYO1AQ9UBC5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MYO1AQ9UBC5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYO1AQ9UBC5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYO1AQ9UBC5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYO1AQ9UBC5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYO1AQ9UBC5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYO1AQ9UBC5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYO1AQ9UBC5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYO1AQ9UBC5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYO1AQ9UBC5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYO1AQ9UBC5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYO1AQ9UBC5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYO1AQ9UBC5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYO1AQ9UBC5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYO1AQ9UBC5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYO1AQ9UBC5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYO1AQ9UBC5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYO1AQ9UBC5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYO1AQ9UBC5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYO1AQ9UBC5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MYO1AQ9UBC5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MYO1AQ9UBC5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MYO1AQ9UBC5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
MYO1AQ9UBC5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MYO1AQ9UBC5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
MYO1AQ9UBC5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MYO1AQ9UBC5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MYO1AQ9UBC5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MYO1AQ9UBC5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MYO1AQ9UBC5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MYO1AQ9UBC5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MYO1AQ9UBC5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYO1AQ9UBC5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYO1AQ9UBC5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYO1AQ9UBC5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYO1AQ9UBC5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MYO1AQ9UBC5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MYO1AQ9UBC5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MYO1AQ9UBC5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MYO1AQ9UBC5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MYO1AQ9UBC5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MYO1AQ9UBC5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MYO1AQ9UBC5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MYO1AQ9UBC5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MYO1AQ9UBC5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MYO1AQ9UBC5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MYO1AQ9UBC5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
MYO1AQ9UBC5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms