Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL9Q9P2J3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL9Q9P2J3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL9Q9P2J3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL9Q9P2J3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL9Q9P2J3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL9Q9P2J3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL9Q9P2J3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL9Q9P2J3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL9Q9P2J3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL9Q9P2J3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL9Q9P2J3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL9Q9P2J3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL9Q9P2J3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL9Q9P2J3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL9Q9P2J3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL9Q9P2J3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL9Q9P2J3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL9Q9P2J3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL9Q9P2J3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL9Q9P2J3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL9Q9P2J3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL9Q9P2J3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL9Q9P2J3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL9Q9P2J3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL9Q9P2J3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL9Q9P2J3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL9Q9P2J3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL9Q9P2J3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL9Q9P2J3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL9Q9P2J3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL9Q9P2J3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL9Q9P2J3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL9Q9P2J3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL9Q9P2J3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL9Q9P2J3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL9Q9P2J3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL9Q9P2J3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL9Q9P2J3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL9Q9P2J3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL9Q9P2J3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL9Q9P2J3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL9Q9P2J3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL9Q9P2J3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL9Q9P2J3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL9Q9P2J3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL9Q9P2J3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL9Q9P2J3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL9Q9P2J3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL9Q9P2J3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL9Q9P2J3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL9Q9P2J3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL9Q9P2J3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL9Q9P2J3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL9Q9P2J3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL9Q9P2J3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL9Q9P2J3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL9Q9P2J3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL9Q9P2J3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL9Q9P2J3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL9Q9P2J3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL9Q9P2J3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL9Q9P2J3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL9Q9P2J3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL9Q9P2J3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
KLHL9Q9P2J3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL9Q9P2J3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL9Q9P2J3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL9Q9P2J3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL9Q9P2J3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL9Q9P2J3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL9Q9P2J3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL9Q9P2J3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL9Q9P2J3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL9Q9P2J3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL9Q9P2J3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL9Q9P2J3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL9Q9P2J3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL9Q9P2J3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL9Q9P2J3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL9Q9P2J3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL9Q9P2J3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL9Q9P2J3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL9Q9P2J3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL9Q9P2J3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL9Q9P2J3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL9Q9P2J3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL9Q9P2J3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL9Q9P2J3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL9Q9P2J3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KLHL9Q9P2J3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KLHL9Q9P2J3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KLHL9Q9P2J3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KLHL9Q9P2J3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL9Q9P2J3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL9Q9P2J3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL9Q9P2J3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL9Q9P2J3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL9Q9P2J3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL9Q9P2J3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms