Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CHMP5Q9NZZ3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHMP5Q9NZZ3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHMP5Q9NZZ3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHMP5Q9NZZ3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHMP5Q9NZZ3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHMP5Q9NZZ3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHMP5Q9NZZ3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CHMP5Q9NZZ3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CHMP5Q9NZZ3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CHMP5Q9NZZ3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CHMP5Q9NZZ3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CHMP5Q9NZZ3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CHMP5Q9NZZ3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CHMP5Q9NZZ3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CHMP5Q9NZZ3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CHMP5Q9NZZ3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CHMP5Q9NZZ3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHMP5Q9NZZ3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHMP5Q9NZZ3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHMP5Q9NZZ3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHMP5Q9NZZ3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHMP5Q9NZZ3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CHMP5Q9NZZ3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHMP5Q9NZZ3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHMP5Q9NZZ3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CHMP5Q9NZZ3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHMP5Q9NZZ3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHMP5Q9NZZ3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHMP5Q9NZZ3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHMP5Q9NZZ3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHMP5Q9NZZ3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHMP5Q9NZZ3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHMP5Q9NZZ3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHMP5Q9NZZ3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CHMP5Q9NZZ3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CHMP5Q9NZZ3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CHMP5Q9NZZ3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CHMP5Q9NZZ3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CHMP5Q9NZZ3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CHMP5Q9NZZ3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CHMP5Q9NZZ3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CHMP5Q9NZZ3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CHMP5Q9NZZ3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CHMP5Q9NZZ3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CHMP5Q9NZZ3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CHMP5Q9NZZ3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CHMP5Q9NZZ3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CHMP5Q9NZZ3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CHMP5Q9NZZ3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CHMP5Q9NZZ3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CHMP5Q9NZZ3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHMP5Q9NZZ3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CHMP5Q9NZZ3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHMP5Q9NZZ3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHMP5Q9NZZ3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CHMP5Q9NZZ3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CHMP5Q9NZZ3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CHMP5Q9NZZ3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHMP5Q9NZZ3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHMP5Q9NZZ3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHMP5Q9NZZ3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHMP5Q9NZZ3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHMP5Q9NZZ3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHMP5Q9NZZ3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHMP5Q9NZZ3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHMP5Q9NZZ3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHMP5Q9NZZ3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHMP5Q9NZZ3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CHMP5Q9NZZ3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CHMP5Q9NZZ3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CHMP5Q9NZZ3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CHMP5Q9NZZ3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CHMP5Q9NZZ3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CHMP5Q9NZZ3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHMP5Q9NZZ3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHMP5Q9NZZ3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CHMP5Q9NZZ3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CHMP5Q9NZZ3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CHMP5Q9NZZ3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CHMP5Q9NZZ3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CHMP5Q9NZZ3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CHMP5Q9NZZ3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHMP5Q9NZZ3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHMP5Q9NZZ3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHMP5Q9NZZ3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CHMP5Q9NZZ3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CHMP5Q9NZZ3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CHMP5Q9NZZ3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHMP5Q9NZZ3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHMP5Q9NZZ3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHMP5Q9NZZ3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CHMP5Q9NZZ3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CHMP5Q9NZZ3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CHMP5Q9NZZ3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CHMP5Q9NZZ3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CHMP5Q9NZZ3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CHMP5Q9NZZ3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CHMP5Q9NZZ3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CHMP5Q9NZZ3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms