Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZJ4

SACS, Sacsin, humanhuman

Predictions only

Length 4,579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SACSQ9NZJ4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SACSQ9NZJ4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SACSQ9NZJ4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SACSQ9NZJ4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SACSQ9NZJ4 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SACSQ9NZJ4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SACSQ9NZJ4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SACSQ9NZJ4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SACSQ9NZJ4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SACSQ9NZJ4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SACSQ9NZJ4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SACSQ9NZJ4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SACSQ9NZJ4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SACSQ9NZJ4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SACSQ9NZJ4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SACSQ9NZJ4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SACSQ9NZJ4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SACSQ9NZJ4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SACSQ9NZJ4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SACSQ9NZJ4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SACSQ9NZJ4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SACSQ9NZJ4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SACSQ9NZJ4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SACSQ9NZJ4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SACSQ9NZJ4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SACSQ9NZJ4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SACSQ9NZJ4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SACSQ9NZJ4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SACSQ9NZJ4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SACSQ9NZJ4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SACSQ9NZJ4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SACSQ9NZJ4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SACSQ9NZJ4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SACSQ9NZJ4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SACSQ9NZJ4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SACSQ9NZJ4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SACSQ9NZJ4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SACSQ9NZJ4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SACSQ9NZJ4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SACSQ9NZJ4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SACSQ9NZJ4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SACSQ9NZJ4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SACSQ9NZJ4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SACSQ9NZJ4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SACSQ9NZJ4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SACSQ9NZJ4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SACSQ9NZJ4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SACSQ9NZJ4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SACSQ9NZJ4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SACSQ9NZJ4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SACSQ9NZJ4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SACSQ9NZJ4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SACSQ9NZJ4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SACSQ9NZJ4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SACSQ9NZJ4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SACSQ9NZJ4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SACSQ9NZJ4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SACSQ9NZJ4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SACSQ9NZJ4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SACSQ9NZJ4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SACSQ9NZJ4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SACSQ9NZJ4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SACSQ9NZJ4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SACSQ9NZJ4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SACSQ9NZJ4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SACSQ9NZJ4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SACSQ9NZJ4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SACSQ9NZJ4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SACSQ9NZJ4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SACSQ9NZJ4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SACSQ9NZJ4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SACSQ9NZJ4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SACSQ9NZJ4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SACSQ9NZJ4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SACSQ9NZJ4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SACSQ9NZJ4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SACSQ9NZJ4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SACSQ9NZJ4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SACSQ9NZJ4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SACSQ9NZJ4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SACSQ9NZJ4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SACSQ9NZJ4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SACSQ9NZJ4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SACSQ9NZJ4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SACSQ9NZJ4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SACSQ9NZJ4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SACSQ9NZJ4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SACSQ9NZJ4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SACSQ9NZJ4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SACSQ9NZJ4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SACSQ9NZJ4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SACSQ9NZJ4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SACSQ9NZJ4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SACSQ9NZJ4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SACSQ9NZJ4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SACSQ9NZJ4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SACSQ9NZJ4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SACSQ9NZJ4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SACSQ9NZJ4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SACSQ9NZJ4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms