Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX61

TMEM161A, Transmembrane protein 161A, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM161AQ9NX61 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMEM161AQ9NX61 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMEM161AQ9NX61 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMEM161AQ9NX61 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMEM161AQ9NX61 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TMEM161AQ9NX61 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TMEM161AQ9NX61 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMEM161AQ9NX61 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMEM161AQ9NX61 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMEM161AQ9NX61 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TMEM161AQ9NX61 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TMEM161AQ9NX61 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMEM161AQ9NX61 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMEM161AQ9NX61 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TMEM161AQ9NX61 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM161AQ9NX61 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM161AQ9NX61 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM161AQ9NX61 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM161AQ9NX61 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM161AQ9NX61 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM161AQ9NX61 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM161AQ9NX61 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMEM161AQ9NX61 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMEM161AQ9NX61 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMEM161AQ9NX61 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMEM161AQ9NX61 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMEM161AQ9NX61 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMEM161AQ9NX61 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMEM161AQ9NX61 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMEM161AQ9NX61 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMEM161AQ9NX61 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMEM161AQ9NX61 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMEM161AQ9NX61 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMEM161AQ9NX61 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMEM161AQ9NX61 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMEM161AQ9NX61 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMEM161AQ9NX61 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMEM161AQ9NX61 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TMEM161AQ9NX61 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMEM161AQ9NX61 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMEM161AQ9NX61 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM161AQ9NX61 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM161AQ9NX61 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM161AQ9NX61 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM161AQ9NX61 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMEM161AQ9NX61 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TMEM161AQ9NX61 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMEM161AQ9NX61 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMEM161AQ9NX61 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMEM161AQ9NX61 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMEM161AQ9NX61 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMEM161AQ9NX61 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMEM161AQ9NX61 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMEM161AQ9NX61 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMEM161AQ9NX61 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMEM161AQ9NX61 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM161AQ9NX61 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM161AQ9NX61 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM161AQ9NX61 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM161AQ9NX61 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM161AQ9NX61 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
TMEM161AQ9NX61 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.92
TMEM161AQ9NX61 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TMEM161AQ9NX61 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMEM161AQ9NX61 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMEM161AQ9NX61 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMEM161AQ9NX61 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMEM161AQ9NX61 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMEM161AQ9NX61 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMEM161AQ9NX61 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TMEM161AQ9NX61 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TMEM161AQ9NX61 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TMEM161AQ9NX61 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TMEM161AQ9NX61 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMEM161AQ9NX61 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMEM161AQ9NX61 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TMEM161AQ9NX61 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TMEM161AQ9NX61 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMEM161AQ9NX61 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMEM161AQ9NX61 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMEM161AQ9NX61 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMEM161AQ9NX61 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMEM161AQ9NX61 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMEM161AQ9NX61 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMEM161AQ9NX61 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMEM161AQ9NX61 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMEM161AQ9NX61 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM161AQ9NX61 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM161AQ9NX61 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM161AQ9NX61 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM161AQ9NX61 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM161AQ9NX61 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM161AQ9NX61 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM161AQ9NX61 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMEM161AQ9NX61 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TMEM161AQ9NX61 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMEM161AQ9NX61 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMEM161AQ9NX61 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMEM161AQ9NX61 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMEM161AQ9NX61 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms