Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX57

RAB20, Ras-related protein Rab-20, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB20Q9NX57 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAB20Q9NX57 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAB20Q9NX57 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAB20Q9NX57 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAB20Q9NX57 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAB20Q9NX57 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAB20Q9NX57 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAB20Q9NX57 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
RAB20Q9NX57 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RAB20Q9NX57 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
RAB20Q9NX57 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RAB20Q9NX57 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
RAB20Q9NX57 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RAB20Q9NX57 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RAB20Q9NX57 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAB20Q9NX57 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAB20Q9NX57 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAB20Q9NX57 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAB20Q9NX57 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
RAB20Q9NX57 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAB20Q9NX57 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAB20Q9NX57 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAB20Q9NX57 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAB20Q9NX57 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAB20Q9NX57 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAB20Q9NX57 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAB20Q9NX57 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RAB20Q9NX57 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RAB20Q9NX57 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RAB20Q9NX57 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RAB20Q9NX57 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAB20Q9NX57 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAB20Q9NX57 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAB20Q9NX57 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAB20Q9NX57 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAB20Q9NX57 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAB20Q9NX57 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAB20Q9NX57 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAB20Q9NX57 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAB20Q9NX57 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RAB20Q9NX57 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RAB20Q9NX57 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RAB20Q9NX57 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RAB20Q9NX57 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RAB20Q9NX57 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
RAB20Q9NX57 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RAB20Q9NX57 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAB20Q9NX57 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAB20Q9NX57 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAB20Q9NX57 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAB20Q9NX57 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAB20Q9NX57 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAB20Q9NX57 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAB20Q9NX57 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAB20Q9NX57 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAB20Q9NX57 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAB20Q9NX57 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAB20Q9NX57 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAB20Q9NX57 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAB20Q9NX57 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAB20Q9NX57 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
RAB20Q9NX57 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAB20Q9NX57 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAB20Q9NX57 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAB20Q9NX57 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAB20Q9NX57 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAB20Q9NX57 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAB20Q9NX57 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAB20Q9NX57 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
RAB20Q9NX57 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAB20Q9NX57 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RAB20Q9NX57 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RAB20Q9NX57 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAB20Q9NX57 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAB20Q9NX57 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAB20Q9NX57 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAB20Q9NX57 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAB20Q9NX57 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAB20Q9NX57 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAB20Q9NX57 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAB20Q9NX57 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAB20Q9NX57 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAB20Q9NX57 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAB20Q9NX57 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAB20Q9NX57 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAB20Q9NX57 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAB20Q9NX57 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAB20Q9NX57 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAB20Q9NX57 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAB20Q9NX57 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAB20Q9NX57 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAB20Q9NX57 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAB20Q9NX57 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAB20Q9NX57 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAB20Q9NX57 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAB20Q9NX57 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAB20Q9NX57 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAB20Q9NX57 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAB20Q9NX57 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAB20Q9NX57 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms