Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TBCCD1Q9NVR7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TBCCD1Q9NVR7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TBCCD1Q9NVR7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TBCCD1Q9NVR7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TBCCD1Q9NVR7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TBCCD1Q9NVR7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TBCCD1Q9NVR7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TBCCD1Q9NVR7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TBCCD1Q9NVR7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TBCCD1Q9NVR7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TBCCD1Q9NVR7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TBCCD1Q9NVR7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TBCCD1Q9NVR7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TBCCD1Q9NVR7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TBCCD1Q9NVR7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TBCCD1Q9NVR7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TBCCD1Q9NVR7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TBCCD1Q9NVR7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBCCD1Q9NVR7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBCCD1Q9NVR7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBCCD1Q9NVR7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBCCD1Q9NVR7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBCCD1Q9NVR7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBCCD1Q9NVR7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TBCCD1Q9NVR7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TBCCD1Q9NVR7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TBCCD1Q9NVR7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TBCCD1Q9NVR7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TBCCD1Q9NVR7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TBCCD1Q9NVR7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TBCCD1Q9NVR7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TBCCD1Q9NVR7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TBCCD1Q9NVR7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TBCCD1Q9NVR7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TBCCD1Q9NVR7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TBCCD1Q9NVR7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TBCCD1Q9NVR7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TBCCD1Q9NVR7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TBCCD1Q9NVR7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TBCCD1Q9NVR7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
TBCCD1Q9NVR7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TBCCD1Q9NVR7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TBCCD1Q9NVR7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TBCCD1Q9NVR7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TBCCD1Q9NVR7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TBCCD1Q9NVR7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TBCCD1Q9NVR7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TBCCD1Q9NVR7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TBCCD1Q9NVR7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TBCCD1Q9NVR7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TBCCD1Q9NVR7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TBCCD1Q9NVR7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TBCCD1Q9NVR7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TBCCD1Q9NVR7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TBCCD1Q9NVR7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TBCCD1Q9NVR7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TBCCD1Q9NVR7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TBCCD1Q9NVR7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TBCCD1Q9NVR7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TBCCD1Q9NVR7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TBCCD1Q9NVR7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TBCCD1Q9NVR7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TBCCD1Q9NVR7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TBCCD1Q9NVR7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TBCCD1Q9NVR7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TBCCD1Q9NVR7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TBCCD1Q9NVR7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TBCCD1Q9NVR7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TBCCD1Q9NVR7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TBCCD1Q9NVR7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TBCCD1Q9NVR7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TBCCD1Q9NVR7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TBCCD1Q9NVR7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TBCCD1Q9NVR7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TBCCD1Q9NVR7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TBCCD1Q9NVR7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TBCCD1Q9NVR7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TBCCD1Q9NVR7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TBCCD1Q9NVR7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TBCCD1Q9NVR7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TBCCD1Q9NVR7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TBCCD1Q9NVR7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TBCCD1Q9NVR7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TBCCD1Q9NVR7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TBCCD1Q9NVR7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TBCCD1Q9NVR7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TBCCD1Q9NVR7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TBCCD1Q9NVR7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TBCCD1Q9NVR7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TBCCD1Q9NVR7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TBCCD1Q9NVR7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TBCCD1Q9NVR7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TBCCD1Q9NVR7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TBCCD1Q9NVR7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TBCCD1Q9NVR7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TBCCD1Q9NVR7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TBCCD1Q9NVR7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TBCCD1Q9NVR7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TBCCD1Q9NVR7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.4 ms