Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUV7

SPTLC3, Serine palmitoyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC3Q9NUV7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPTLC3Q9NUV7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SPTLC3Q9NUV7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SPTLC3Q9NUV7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SPTLC3Q9NUV7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SPTLC3Q9NUV7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SPTLC3Q9NUV7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SPTLC3Q9NUV7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPTLC3Q9NUV7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPTLC3Q9NUV7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPTLC3Q9NUV7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPTLC3Q9NUV7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPTLC3Q9NUV7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPTLC3Q9NUV7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SPTLC3Q9NUV7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SPTLC3Q9NUV7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPTLC3Q9NUV7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPTLC3Q9NUV7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPTLC3Q9NUV7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SPTLC3Q9NUV7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SPTLC3Q9NUV7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SPTLC3Q9NUV7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPTLC3Q9NUV7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPTLC3Q9NUV7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPTLC3Q9NUV7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPTLC3Q9NUV7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPTLC3Q9NUV7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPTLC3Q9NUV7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPTLC3Q9NUV7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPTLC3Q9NUV7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPTLC3Q9NUV7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPTLC3Q9NUV7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPTLC3Q9NUV7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPTLC3Q9NUV7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SPTLC3Q9NUV7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPTLC3Q9NUV7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPTLC3Q9NUV7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPTLC3Q9NUV7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPTLC3Q9NUV7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPTLC3Q9NUV7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPTLC3Q9NUV7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPTLC3Q9NUV7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SPTLC3Q9NUV7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SPTLC3Q9NUV7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SPTLC3Q9NUV7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SPTLC3Q9NUV7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SPTLC3Q9NUV7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPTLC3Q9NUV7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPTLC3Q9NUV7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SPTLC3Q9NUV7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPTLC3Q9NUV7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPTLC3Q9NUV7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPTLC3Q9NUV7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPTLC3Q9NUV7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPTLC3Q9NUV7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPTLC3Q9NUV7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPTLC3Q9NUV7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPTLC3Q9NUV7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPTLC3Q9NUV7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SPTLC3Q9NUV7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SPTLC3Q9NUV7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SPTLC3Q9NUV7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPTLC3Q9NUV7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPTLC3Q9NUV7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPTLC3Q9NUV7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPTLC3Q9NUV7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPTLC3Q9NUV7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPTLC3Q9NUV7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPTLC3Q9NUV7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPTLC3Q9NUV7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPTLC3Q9NUV7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPTLC3Q9NUV7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPTLC3Q9NUV7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SPTLC3Q9NUV7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SPTLC3Q9NUV7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SPTLC3Q9NUV7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SPTLC3Q9NUV7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SPTLC3Q9NUV7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SPTLC3Q9NUV7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPTLC3Q9NUV7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPTLC3Q9NUV7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPTLC3Q9NUV7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPTLC3Q9NUV7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPTLC3Q9NUV7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPTLC3Q9NUV7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPTLC3Q9NUV7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPTLC3Q9NUV7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPTLC3Q9NUV7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPTLC3Q9NUV7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPTLC3Q9NUV7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPTLC3Q9NUV7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPTLC3Q9NUV7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPTLC3Q9NUV7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPTLC3Q9NUV7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPTLC3Q9NUV7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPTLC3Q9NUV7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPTLC3Q9NUV7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPTLC3Q9NUV7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPTLC3Q9NUV7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPTLC3Q9NUV7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms