Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SMC4Q9NTJ3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SMC4Q9NTJ3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SMC4Q9NTJ3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
SMC4Q9NTJ3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
SMC4Q9NTJ3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
SMC4Q9NTJ3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SMC4Q9NTJ3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SMC4Q9NTJ3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SMC4Q9NTJ3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SMC4Q9NTJ3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SMC4Q9NTJ3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SMC4Q9NTJ3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SMC4Q9NTJ3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SMC4Q9NTJ3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SMC4Q9NTJ3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SMC4Q9NTJ3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SMC4Q9NTJ3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SMC4Q9NTJ3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SMC4Q9NTJ3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SMC4Q9NTJ3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SMC4Q9NTJ3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SMC4Q9NTJ3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SMC4Q9NTJ3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SMC4Q9NTJ3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SMC4Q9NTJ3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SMC4Q9NTJ3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SMC4Q9NTJ3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SMC4Q9NTJ3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SMC4Q9NTJ3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SMC4Q9NTJ3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SMC4Q9NTJ3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SMC4Q9NTJ3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SMC4Q9NTJ3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SMC4Q9NTJ3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SMC4Q9NTJ3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SMC4Q9NTJ3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SMC4Q9NTJ3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
SMC4Q9NTJ3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
SMC4Q9NTJ3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
SMC4Q9NTJ3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
SMC4Q9NTJ3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SMC4Q9NTJ3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC32■■■□□ 2.71
SMC4Q9NTJ3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SMC4Q9NTJ3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SMC4Q9NTJ3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SMC4Q9NTJ3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SMC4Q9NTJ3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SMC4Q9NTJ3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SMC4Q9NTJ3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SMC4Q9NTJ3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SMC4Q9NTJ3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SMC4Q9NTJ3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SMC4Q9NTJ3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SMC4Q9NTJ3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SMC4Q9NTJ3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
SMC4Q9NTJ3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SMC4Q9NTJ3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SMC4Q9NTJ3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SMC4Q9NTJ3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SMC4Q9NTJ3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SMC4Q9NTJ3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
SMC4Q9NTJ3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
SMC4Q9NTJ3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
SMC4Q9NTJ3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
SMC4Q9NTJ3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
SMC4Q9NTJ3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
SMC4Q9NTJ3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
SMC4Q9NTJ3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
SMC4Q9NTJ3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
SMC4Q9NTJ3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
SMC4Q9NTJ3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
SMC4Q9NTJ3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
SMC4Q9NTJ3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
SMC4Q9NTJ3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
SMC4Q9NTJ3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
SMC4Q9NTJ3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC31.9■■■□□ 2.7
SMC4Q9NTJ3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
SMC4Q9NTJ3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
SMC4Q9NTJ3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
SMC4Q9NTJ3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
SMC4Q9NTJ3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
SMC4Q9NTJ3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
SMC4Q9NTJ3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
SMC4Q9NTJ3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
SMC4Q9NTJ3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC31.88■■■□□ 2.69
SMC4Q9NTJ3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
SMC4Q9NTJ3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
SMC4Q9NTJ3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
SMC4Q9NTJ3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC31.86■■■□□ 2.69
SMC4Q9NTJ3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
SMC4Q9NTJ3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
SMC4Q9NTJ3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC31.86■■■□□ 2.69
SMC4Q9NTJ3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
SMC4Q9NTJ3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
SMC4Q9NTJ3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
SMC4Q9NTJ3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
SMC4Q9NTJ3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
SMC4Q9NTJ3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
SMC4Q9NTJ3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.3 ms