Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQR4

NIT2, Omega-amidase NIT2, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIT2Q9NQR4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NIT2Q9NQR4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIT2Q9NQR4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIT2Q9NQR4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIT2Q9NQR4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIT2Q9NQR4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIT2Q9NQR4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIT2Q9NQR4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIT2Q9NQR4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIT2Q9NQR4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIT2Q9NQR4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIT2Q9NQR4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIT2Q9NQR4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIT2Q9NQR4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIT2Q9NQR4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIT2Q9NQR4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIT2Q9NQR4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIT2Q9NQR4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIT2Q9NQR4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIT2Q9NQR4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIT2Q9NQR4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NIT2Q9NQR4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIT2Q9NQR4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIT2Q9NQR4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIT2Q9NQR4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIT2Q9NQR4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIT2Q9NQR4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIT2Q9NQR4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIT2Q9NQR4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIT2Q9NQR4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIT2Q9NQR4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIT2Q9NQR4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIT2Q9NQR4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIT2Q9NQR4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NIT2Q9NQR4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NIT2Q9NQR4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NIT2Q9NQR4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIT2Q9NQR4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIT2Q9NQR4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIT2Q9NQR4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIT2Q9NQR4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIT2Q9NQR4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIT2Q9NQR4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIT2Q9NQR4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIT2Q9NQR4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIT2Q9NQR4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIT2Q9NQR4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIT2Q9NQR4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIT2Q9NQR4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIT2Q9NQR4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIT2Q9NQR4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIT2Q9NQR4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NIT2Q9NQR4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NIT2Q9NQR4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NIT2Q9NQR4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIT2Q9NQR4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIT2Q9NQR4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NIT2Q9NQR4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIT2Q9NQR4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIT2Q9NQR4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NIT2Q9NQR4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIT2Q9NQR4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIT2Q9NQR4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIT2Q9NQR4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIT2Q9NQR4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIT2Q9NQR4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NIT2Q9NQR4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NIT2Q9NQR4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NIT2Q9NQR4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NIT2Q9NQR4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NIT2Q9NQR4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NIT2Q9NQR4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NIT2Q9NQR4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NIT2Q9NQR4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NIT2Q9NQR4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NIT2Q9NQR4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NIT2Q9NQR4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NIT2Q9NQR4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NIT2Q9NQR4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NIT2Q9NQR4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NIT2Q9NQR4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NIT2Q9NQR4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NIT2Q9NQR4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NIT2Q9NQR4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NIT2Q9NQR4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NIT2Q9NQR4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NIT2Q9NQR4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NIT2Q9NQR4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NIT2Q9NQR4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NIT2Q9NQR4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NIT2Q9NQR4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NIT2Q9NQR4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NIT2Q9NQR4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NIT2Q9NQR4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NIT2Q9NQR4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NIT2Q9NQR4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NIT2Q9NQR4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NIT2Q9NQR4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NIT2Q9NQR4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NIT2Q9NQR4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms