Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NRIP3Q9NQ35 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NRIP3Q9NQ35 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NRIP3Q9NQ35 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NRIP3Q9NQ35 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NRIP3Q9NQ35 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NRIP3Q9NQ35 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NRIP3Q9NQ35 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NRIP3Q9NQ35 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NRIP3Q9NQ35 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NRIP3Q9NQ35 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NRIP3Q9NQ35 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NRIP3Q9NQ35 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NRIP3Q9NQ35 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NRIP3Q9NQ35 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NRIP3Q9NQ35 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NRIP3Q9NQ35 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NRIP3Q9NQ35 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NRIP3Q9NQ35 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NRIP3Q9NQ35 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NRIP3Q9NQ35 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NRIP3Q9NQ35 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NRIP3Q9NQ35 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NRIP3Q9NQ35 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NRIP3Q9NQ35 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NRIP3Q9NQ35 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NRIP3Q9NQ35 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NRIP3Q9NQ35 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NRIP3Q9NQ35 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NRIP3Q9NQ35 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NRIP3Q9NQ35 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NRIP3Q9NQ35 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NRIP3Q9NQ35 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRIP3Q9NQ35 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRIP3Q9NQ35 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRIP3Q9NQ35 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRIP3Q9NQ35 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRIP3Q9NQ35 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRIP3Q9NQ35 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRIP3Q9NQ35 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NRIP3Q9NQ35 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NRIP3Q9NQ35 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NRIP3Q9NQ35 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NRIP3Q9NQ35 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NRIP3Q9NQ35 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NRIP3Q9NQ35 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NRIP3Q9NQ35 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NRIP3Q9NQ35 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NRIP3Q9NQ35 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NRIP3Q9NQ35 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NRIP3Q9NQ35 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NRIP3Q9NQ35 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NRIP3Q9NQ35 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NRIP3Q9NQ35 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NRIP3Q9NQ35 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NRIP3Q9NQ35 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NRIP3Q9NQ35 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NRIP3Q9NQ35 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NRIP3Q9NQ35 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NRIP3Q9NQ35 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NRIP3Q9NQ35 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NRIP3Q9NQ35 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NRIP3Q9NQ35 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NRIP3Q9NQ35 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NRIP3Q9NQ35 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NRIP3Q9NQ35 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NRIP3Q9NQ35 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NRIP3Q9NQ35 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NRIP3Q9NQ35 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NRIP3Q9NQ35 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NRIP3Q9NQ35 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NRIP3Q9NQ35 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NRIP3Q9NQ35 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NRIP3Q9NQ35 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NRIP3Q9NQ35 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NRIP3Q9NQ35 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NRIP3Q9NQ35 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NRIP3Q9NQ35 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NRIP3Q9NQ35 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NRIP3Q9NQ35 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NRIP3Q9NQ35 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NRIP3Q9NQ35 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NRIP3Q9NQ35 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NRIP3Q9NQ35 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NRIP3Q9NQ35 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NRIP3Q9NQ35 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NRIP3Q9NQ35 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NRIP3Q9NQ35 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NRIP3Q9NQ35 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NRIP3Q9NQ35 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NRIP3Q9NQ35 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NRIP3Q9NQ35 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NRIP3Q9NQ35 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NRIP3Q9NQ35 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NRIP3Q9NQ35 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NRIP3Q9NQ35 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NRIP3Q9NQ35 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NRIP3Q9NQ35 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NRIP3Q9NQ35 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NRIP3Q9NQ35 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms