Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ASCL3Q9NQ33 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ASCL3Q9NQ33 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ASCL3Q9NQ33 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ASCL3Q9NQ33 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ASCL3Q9NQ33 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ASCL3Q9NQ33 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ASCL3Q9NQ33 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ASCL3Q9NQ33 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ASCL3Q9NQ33 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ASCL3Q9NQ33 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ASCL3Q9NQ33 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ASCL3Q9NQ33 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ASCL3Q9NQ33 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ASCL3Q9NQ33 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ASCL3Q9NQ33 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ASCL3Q9NQ33 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ASCL3Q9NQ33 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ASCL3Q9NQ33 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ASCL3Q9NQ33 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ASCL3Q9NQ33 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ASCL3Q9NQ33 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ASCL3Q9NQ33 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ASCL3Q9NQ33 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ASCL3Q9NQ33 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ASCL3Q9NQ33 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ASCL3Q9NQ33 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ASCL3Q9NQ33 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ASCL3Q9NQ33 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ASCL3Q9NQ33 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ASCL3Q9NQ33 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ASCL3Q9NQ33 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ASCL3Q9NQ33 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ASCL3Q9NQ33 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ASCL3Q9NQ33 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ASCL3Q9NQ33 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ASCL3Q9NQ33 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ASCL3Q9NQ33 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ASCL3Q9NQ33 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ASCL3Q9NQ33 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ASCL3Q9NQ33 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ASCL3Q9NQ33 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ASCL3Q9NQ33 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ASCL3Q9NQ33 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ASCL3Q9NQ33 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ASCL3Q9NQ33 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ASCL3Q9NQ33 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ASCL3Q9NQ33 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ASCL3Q9NQ33 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ASCL3Q9NQ33 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ASCL3Q9NQ33 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ASCL3Q9NQ33 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ASCL3Q9NQ33 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ASCL3Q9NQ33 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ASCL3Q9NQ33 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ASCL3Q9NQ33 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ASCL3Q9NQ33 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ASCL3Q9NQ33 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ASCL3Q9NQ33 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ASCL3Q9NQ33 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ASCL3Q9NQ33 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ASCL3Q9NQ33 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ASCL3Q9NQ33 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ASCL3Q9NQ33 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ASCL3Q9NQ33 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ASCL3Q9NQ33 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ASCL3Q9NQ33 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ASCL3Q9NQ33 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ASCL3Q9NQ33 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ASCL3Q9NQ33 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ASCL3Q9NQ33 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ASCL3Q9NQ33 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ASCL3Q9NQ33 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ASCL3Q9NQ33 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ASCL3Q9NQ33 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ASCL3Q9NQ33 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ASCL3Q9NQ33 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ASCL3Q9NQ33 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ASCL3Q9NQ33 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ASCL3Q9NQ33 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ASCL3Q9NQ33 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ASCL3Q9NQ33 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ASCL3Q9NQ33 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ASCL3Q9NQ33 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ASCL3Q9NQ33 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ASCL3Q9NQ33 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ASCL3Q9NQ33 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ASCL3Q9NQ33 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ASCL3Q9NQ33 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ASCL3Q9NQ33 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ASCL3Q9NQ33 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ASCL3Q9NQ33 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ASCL3Q9NQ33 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ASCL3Q9NQ33 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ASCL3Q9NQ33 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ASCL3Q9NQ33 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ASCL3Q9NQ33 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ASCL3Q9NQ33 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ASCL3Q9NQ33 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ASCL3Q9NQ33 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms