Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ8

TMEM27, Collectrin, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM27Q9HBJ8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMEM27Q9HBJ8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM27Q9HBJ8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM27Q9HBJ8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM27Q9HBJ8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM27Q9HBJ8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM27Q9HBJ8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM27Q9HBJ8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM27Q9HBJ8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM27Q9HBJ8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM27Q9HBJ8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM27Q9HBJ8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM27Q9HBJ8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM27Q9HBJ8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM27Q9HBJ8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM27Q9HBJ8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM27Q9HBJ8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM27Q9HBJ8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM27Q9HBJ8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM27Q9HBJ8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM27Q9HBJ8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM27Q9HBJ8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM27Q9HBJ8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM27Q9HBJ8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM27Q9HBJ8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM27Q9HBJ8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM27Q9HBJ8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM27Q9HBJ8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM27Q9HBJ8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM27Q9HBJ8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM27Q9HBJ8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM27Q9HBJ8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM27Q9HBJ8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM27Q9HBJ8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM27Q9HBJ8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM27Q9HBJ8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM27Q9HBJ8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM27Q9HBJ8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM27Q9HBJ8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM27Q9HBJ8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM27Q9HBJ8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM27Q9HBJ8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM27Q9HBJ8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM27Q9HBJ8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM27Q9HBJ8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM27Q9HBJ8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM27Q9HBJ8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM27Q9HBJ8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM27Q9HBJ8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM27Q9HBJ8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM27Q9HBJ8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM27Q9HBJ8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM27Q9HBJ8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM27Q9HBJ8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM27Q9HBJ8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM27Q9HBJ8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM27Q9HBJ8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM27Q9HBJ8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM27Q9HBJ8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM27Q9HBJ8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM27Q9HBJ8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM27Q9HBJ8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM27Q9HBJ8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TMEM27Q9HBJ8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM27Q9HBJ8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM27Q9HBJ8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM27Q9HBJ8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM27Q9HBJ8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM27Q9HBJ8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM27Q9HBJ8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM27Q9HBJ8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM27Q9HBJ8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM27Q9HBJ8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM27Q9HBJ8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM27Q9HBJ8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM27Q9HBJ8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM27Q9HBJ8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM27Q9HBJ8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM27Q9HBJ8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM27Q9HBJ8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM27Q9HBJ8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM27Q9HBJ8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM27Q9HBJ8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM27Q9HBJ8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM27Q9HBJ8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM27Q9HBJ8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM27Q9HBJ8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM27Q9HBJ8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM27Q9HBJ8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM27Q9HBJ8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM27Q9HBJ8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM27Q9HBJ8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM27Q9HBJ8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM27Q9HBJ8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM27Q9HBJ8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM27Q9HBJ8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM27Q9HBJ8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM27Q9HBJ8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM27Q9HBJ8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM27Q9HBJ8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.5 ms