Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4E5

RHOJ, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOJQ9H4E5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RHOJQ9H4E5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RHOJQ9H4E5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RHOJQ9H4E5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RHOJQ9H4E5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RHOJQ9H4E5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RHOJQ9H4E5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RHOJQ9H4E5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RHOJQ9H4E5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RHOJQ9H4E5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RHOJQ9H4E5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RHOJQ9H4E5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RHOJQ9H4E5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RHOJQ9H4E5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RHOJQ9H4E5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RHOJQ9H4E5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RHOJQ9H4E5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RHOJQ9H4E5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RHOJQ9H4E5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RHOJQ9H4E5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RHOJQ9H4E5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RHOJQ9H4E5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RHOJQ9H4E5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RHOJQ9H4E5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RHOJQ9H4E5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RHOJQ9H4E5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RHOJQ9H4E5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RHOJQ9H4E5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RHOJQ9H4E5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RHOJQ9H4E5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RHOJQ9H4E5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHOJQ9H4E5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHOJQ9H4E5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RHOJQ9H4E5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RHOJQ9H4E5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RHOJQ9H4E5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RHOJQ9H4E5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RHOJQ9H4E5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RHOJQ9H4E5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RHOJQ9H4E5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RHOJQ9H4E5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RHOJQ9H4E5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RHOJQ9H4E5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RHOJQ9H4E5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RHOJQ9H4E5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RHOJQ9H4E5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RHOJQ9H4E5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHOJQ9H4E5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHOJQ9H4E5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RHOJQ9H4E5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RHOJQ9H4E5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RHOJQ9H4E5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RHOJQ9H4E5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RHOJQ9H4E5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RHOJQ9H4E5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RHOJQ9H4E5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RHOJQ9H4E5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RHOJQ9H4E5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RHOJQ9H4E5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RHOJQ9H4E5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RHOJQ9H4E5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHOJQ9H4E5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHOJQ9H4E5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHOJQ9H4E5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHOJQ9H4E5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHOJQ9H4E5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHOJQ9H4E5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHOJQ9H4E5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RHOJQ9H4E5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RHOJQ9H4E5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RHOJQ9H4E5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RHOJQ9H4E5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RHOJQ9H4E5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RHOJQ9H4E5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RHOJQ9H4E5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RHOJQ9H4E5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RHOJQ9H4E5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RHOJQ9H4E5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RHOJQ9H4E5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RHOJQ9H4E5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHOJQ9H4E5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHOJQ9H4E5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RHOJQ9H4E5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RHOJQ9H4E5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RHOJQ9H4E5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RHOJQ9H4E5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RHOJQ9H4E5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RHOJQ9H4E5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RHOJQ9H4E5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RHOJQ9H4E5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RHOJQ9H4E5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RHOJQ9H4E5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RHOJQ9H4E5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RHOJQ9H4E5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RHOJQ9H4E5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RHOJQ9H4E5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RHOJQ9H4E5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RHOJQ9H4E5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RHOJQ9H4E5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RHOJQ9H4E5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms