Protein–RNA interactions for Protein: Q9H082

RAB33B, Ras-related protein Rab-33B, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB33BQ9H082 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB33BQ9H082 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB33BQ9H082 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB33BQ9H082 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB33BQ9H082 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB33BQ9H082 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB33BQ9H082 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB33BQ9H082 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB33BQ9H082 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB33BQ9H082 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB33BQ9H082 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB33BQ9H082 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB33BQ9H082 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB33BQ9H082 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB33BQ9H082 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB33BQ9H082 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RAB33BQ9H082 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RAB33BQ9H082 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB33BQ9H082 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB33BQ9H082 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB33BQ9H082 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB33BQ9H082 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB33BQ9H082 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB33BQ9H082 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB33BQ9H082 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB33BQ9H082 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB33BQ9H082 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB33BQ9H082 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB33BQ9H082 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB33BQ9H082 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB33BQ9H082 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB33BQ9H082 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB33BQ9H082 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB33BQ9H082 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB33BQ9H082 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB33BQ9H082 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB33BQ9H082 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB33BQ9H082 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB33BQ9H082 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB33BQ9H082 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB33BQ9H082 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB33BQ9H082 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB33BQ9H082 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB33BQ9H082 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB33BQ9H082 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB33BQ9H082 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB33BQ9H082 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB33BQ9H082 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB33BQ9H082 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB33BQ9H082 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB33BQ9H082 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB33BQ9H082 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB33BQ9H082 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB33BQ9H082 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB33BQ9H082 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB33BQ9H082 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB33BQ9H082 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB33BQ9H082 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB33BQ9H082 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB33BQ9H082 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB33BQ9H082 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB33BQ9H082 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB33BQ9H082 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB33BQ9H082 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB33BQ9H082 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB33BQ9H082 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB33BQ9H082 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB33BQ9H082 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB33BQ9H082 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB33BQ9H082 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB33BQ9H082 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB33BQ9H082 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB33BQ9H082 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB33BQ9H082 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB33BQ9H082 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB33BQ9H082 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB33BQ9H082 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB33BQ9H082 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB33BQ9H082 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB33BQ9H082 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB33BQ9H082 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB33BQ9H082 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB33BQ9H082 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB33BQ9H082 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB33BQ9H082 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB33BQ9H082 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB33BQ9H082 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB33BQ9H082 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB33BQ9H082 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB33BQ9H082 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB33BQ9H082 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB33BQ9H082 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB33BQ9H082 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB33BQ9H082 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB33BQ9H082 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB33BQ9H082 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB33BQ9H082 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB33BQ9H082 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB33BQ9H082 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB33BQ9H082 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms