Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC90BQ9GZT6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC90BQ9GZT6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC90BQ9GZT6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC90BQ9GZT6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC90BQ9GZT6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC90BQ9GZT6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC90BQ9GZT6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC90BQ9GZT6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC90BQ9GZT6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC90BQ9GZT6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC90BQ9GZT6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC90BQ9GZT6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC90BQ9GZT6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC90BQ9GZT6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC90BQ9GZT6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC90BQ9GZT6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC90BQ9GZT6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC90BQ9GZT6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC90BQ9GZT6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC90BQ9GZT6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC90BQ9GZT6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC90BQ9GZT6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC90BQ9GZT6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC90BQ9GZT6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC90BQ9GZT6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC90BQ9GZT6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC90BQ9GZT6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC90BQ9GZT6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC90BQ9GZT6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC90BQ9GZT6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC90BQ9GZT6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC90BQ9GZT6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC90BQ9GZT6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC90BQ9GZT6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC90BQ9GZT6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC90BQ9GZT6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC90BQ9GZT6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC90BQ9GZT6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC90BQ9GZT6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC90BQ9GZT6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC90BQ9GZT6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC90BQ9GZT6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC90BQ9GZT6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC90BQ9GZT6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC90BQ9GZT6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC90BQ9GZT6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC90BQ9GZT6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC90BQ9GZT6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC90BQ9GZT6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC90BQ9GZT6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC90BQ9GZT6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC90BQ9GZT6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC90BQ9GZT6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC90BQ9GZT6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC90BQ9GZT6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC90BQ9GZT6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC90BQ9GZT6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC90BQ9GZT6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC90BQ9GZT6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC90BQ9GZT6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC90BQ9GZT6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC90BQ9GZT6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC90BQ9GZT6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC90BQ9GZT6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC90BQ9GZT6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC90BQ9GZT6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC90BQ9GZT6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC90BQ9GZT6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC90BQ9GZT6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC90BQ9GZT6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC90BQ9GZT6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC90BQ9GZT6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC90BQ9GZT6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC90BQ9GZT6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC90BQ9GZT6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC90BQ9GZT6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC90BQ9GZT6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC90BQ9GZT6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC90BQ9GZT6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC90BQ9GZT6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC90BQ9GZT6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC90BQ9GZT6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC90BQ9GZT6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC90BQ9GZT6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC90BQ9GZT6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC90BQ9GZT6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC90BQ9GZT6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC90BQ9GZT6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC90BQ9GZT6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC90BQ9GZT6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC90BQ9GZT6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC90BQ9GZT6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC90BQ9GZT6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC90BQ9GZT6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC90BQ9GZT6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC90BQ9GZT6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC90BQ9GZT6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC90BQ9GZT6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC90BQ9GZT6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms