Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B2

CFAP74, Cilia- and flagella-associated protein 74, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP74Q9C0B2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC38.63■■■■□ 3.77
CFAP74Q9C0B2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.77
CFAP74Q9C0B2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC38.62■■■■□ 3.77
CFAP74Q9C0B2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC38.62■■■■□ 3.77
CFAP74Q9C0B2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC38.62■■■■□ 3.77
CFAP74Q9C0B2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC38.62■■■■□ 3.77
CFAP74Q9C0B2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
CFAP74Q9C0B2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
CFAP74Q9C0B2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC38.61■■■■□ 3.77
CFAP74Q9C0B2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC38.61■■■■□ 3.77
CFAP74Q9C0B2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC38.61■■■■□ 3.77
CFAP74Q9C0B2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
CFAP74Q9C0B2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC38.61■■■■□ 3.77
CFAP74Q9C0B2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
CFAP74Q9C0B2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
CFAP74Q9C0B2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC38.61■■■■□ 3.77
CFAP74Q9C0B2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
CFAP74Q9C0B2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
CFAP74Q9C0B2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
CFAP74Q9C0B2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
CFAP74Q9C0B2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC38.6■■■■□ 3.77
CFAP74Q9C0B2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
CFAP74Q9C0B2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
CFAP74Q9C0B2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
CFAP74Q9C0B2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC38.57■■■■□ 3.76
CFAP74Q9C0B2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
CFAP74Q9C0B2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
CFAP74Q9C0B2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
CFAP74Q9C0B2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
CFAP74Q9C0B2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
CFAP74Q9C0B2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC38.54■■■■□ 3.76
CFAP74Q9C0B2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
CFAP74Q9C0B2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
CFAP74Q9C0B2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.53■■■■□ 3.76
CFAP74Q9C0B2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC38.53■■■■□ 3.76
CFAP74Q9C0B2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC38.53■■■■□ 3.76
CFAP74Q9C0B2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
CFAP74Q9C0B2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
CFAP74Q9C0B2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
CFAP74Q9C0B2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
CFAP74Q9C0B2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
CFAP74Q9C0B2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
CFAP74Q9C0B2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
CFAP74Q9C0B2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
CFAP74Q9C0B2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
CFAP74Q9C0B2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.5■■■■□ 3.75
CFAP74Q9C0B2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
CFAP74Q9C0B2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC38.5■■■■□ 3.75
CFAP74Q9C0B2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
CFAP74Q9C0B2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
CFAP74Q9C0B2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
CFAP74Q9C0B2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC38.48■■■■□ 3.75
CFAP74Q9C0B2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
CFAP74Q9C0B2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
CFAP74Q9C0B2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC38.47■■■■□ 3.75
CFAP74Q9C0B2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
CFAP74Q9C0B2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
CFAP74Q9C0B2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
CFAP74Q9C0B2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.46■■■■□ 3.75
CFAP74Q9C0B2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
CFAP74Q9C0B2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC38.46■■■■□ 3.75
CFAP74Q9C0B2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
CFAP74Q9C0B2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC38.46■■■■□ 3.75
CFAP74Q9C0B2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
CFAP74Q9C0B2 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC38.45■■■■□ 3.75
CFAP74Q9C0B2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
CFAP74Q9C0B2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
CFAP74Q9C0B2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.74
CFAP74Q9C0B2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC38.44■■■■□ 3.74
CFAP74Q9C0B2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC38.44■■■■□ 3.74
CFAP74Q9C0B2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC38.44■■■■□ 3.74
CFAP74Q9C0B2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
CFAP74Q9C0B2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
CFAP74Q9C0B2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC38.43■■■■□ 3.74
CFAP74Q9C0B2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
CFAP74Q9C0B2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
CFAP74Q9C0B2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
CFAP74Q9C0B2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
CFAP74Q9C0B2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC38.42■■■■□ 3.74
CFAP74Q9C0B2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
CFAP74Q9C0B2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
CFAP74Q9C0B2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC38.4■■■■□ 3.74
CFAP74Q9C0B2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.4■■■■□ 3.74
CFAP74Q9C0B2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
CFAP74Q9C0B2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
CFAP74Q9C0B2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
CFAP74Q9C0B2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
CFAP74Q9C0B2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
CFAP74Q9C0B2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
CFAP74Q9C0B2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC38.38■■■■□ 3.73
CFAP74Q9C0B2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
CFAP74Q9C0B2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
CFAP74Q9C0B2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
CFAP74Q9C0B2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
CFAP74Q9C0B2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
CFAP74Q9C0B2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
CFAP74Q9C0B2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
CFAP74Q9C0B2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
CFAP74Q9C0B2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
CFAP74Q9C0B2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms