Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC4A5Q9BY07 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC4A5Q9BY07 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC4A5Q9BY07 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC4A5Q9BY07 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC4A5Q9BY07 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC4A5Q9BY07 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC4A5Q9BY07 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC4A5Q9BY07 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC4A5Q9BY07 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC4A5Q9BY07 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC4A5Q9BY07 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC4A5Q9BY07 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC4A5Q9BY07 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC4A5Q9BY07 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC4A5Q9BY07 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC4A5Q9BY07 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC4A5Q9BY07 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC4A5Q9BY07 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC4A5Q9BY07 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC4A5Q9BY07 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC4A5Q9BY07 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC4A5Q9BY07 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC4A5Q9BY07 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC4A5Q9BY07 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC4A5Q9BY07 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC4A5Q9BY07 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC4A5Q9BY07 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC4A5Q9BY07 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC4A5Q9BY07 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC4A5Q9BY07 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC4A5Q9BY07 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC4A5Q9BY07 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC4A5Q9BY07 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC4A5Q9BY07 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC4A5Q9BY07 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC4A5Q9BY07 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC4A5Q9BY07 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC4A5Q9BY07 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC4A5Q9BY07 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC4A5Q9BY07 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC4A5Q9BY07 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC4A5Q9BY07 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC4A5Q9BY07 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC4A5Q9BY07 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC4A5Q9BY07 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC4A5Q9BY07 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC4A5Q9BY07 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC4A5Q9BY07 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC4A5Q9BY07 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC4A5Q9BY07 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC4A5Q9BY07 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC4A5Q9BY07 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC4A5Q9BY07 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC4A5Q9BY07 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC4A5Q9BY07 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC4A5Q9BY07 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC4A5Q9BY07 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC4A5Q9BY07 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC4A5Q9BY07 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC4A5Q9BY07 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC4A5Q9BY07 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC4A5Q9BY07 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC4A5Q9BY07 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC4A5Q9BY07 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC4A5Q9BY07 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC4A5Q9BY07 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC4A5Q9BY07 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC4A5Q9BY07 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SLC4A5Q9BY07 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC4A5Q9BY07 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC4A5Q9BY07 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC4A5Q9BY07 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC4A5Q9BY07 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC4A5Q9BY07 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC4A5Q9BY07 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC4A5Q9BY07 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC4A5Q9BY07 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC4A5Q9BY07 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC4A5Q9BY07 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC4A5Q9BY07 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC4A5Q9BY07 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC4A5Q9BY07 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC4A5Q9BY07 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC4A5Q9BY07 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC4A5Q9BY07 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC4A5Q9BY07 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC4A5Q9BY07 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC4A5Q9BY07 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC4A5Q9BY07 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC4A5Q9BY07 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC4A5Q9BY07 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC4A5Q9BY07 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC4A5Q9BY07 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC4A5Q9BY07 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC4A5Q9BY07 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC4A5Q9BY07 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC4A5Q9BY07 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC4A5Q9BY07 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC4A5Q9BY07 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms