Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SRRTQ9BXP5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SRRTQ9BXP5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SRRTQ9BXP5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SRRTQ9BXP5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SRRTQ9BXP5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SRRTQ9BXP5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SRRTQ9BXP5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SRRTQ9BXP5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SRRTQ9BXP5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SRRTQ9BXP5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SRRTQ9BXP5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SRRTQ9BXP5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SRRTQ9BXP5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SRRTQ9BXP5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SRRTQ9BXP5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SRRTQ9BXP5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SRRTQ9BXP5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SRRTQ9BXP5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SRRTQ9BXP5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SRRTQ9BXP5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SRRTQ9BXP5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SRRTQ9BXP5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SRRTQ9BXP5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SRRTQ9BXP5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SRRTQ9BXP5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SRRTQ9BXP5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SRRTQ9BXP5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SRRTQ9BXP5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SRRTQ9BXP5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SRRTQ9BXP5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SRRTQ9BXP5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SRRTQ9BXP5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SRRTQ9BXP5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SRRTQ9BXP5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SRRTQ9BXP5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SRRTQ9BXP5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SRRTQ9BXP5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SRRTQ9BXP5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SRRTQ9BXP5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SRRTQ9BXP5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SRRTQ9BXP5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRRTQ9BXP5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRRTQ9BXP5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRRTQ9BXP5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRRTQ9BXP5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRRTQ9BXP5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRRTQ9BXP5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRRTQ9BXP5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SRRTQ9BXP5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SRRTQ9BXP5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SRRTQ9BXP5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SRRTQ9BXP5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SRRTQ9BXP5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SRRTQ9BXP5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SRRTQ9BXP5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SRRTQ9BXP5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SRRTQ9BXP5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SRRTQ9BXP5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SRRTQ9BXP5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SRRTQ9BXP5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SRRTQ9BXP5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SRRTQ9BXP5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SRRTQ9BXP5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SRRTQ9BXP5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SRRTQ9BXP5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SRRTQ9BXP5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SRRTQ9BXP5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SRRTQ9BXP5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SRRTQ9BXP5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SRRTQ9BXP5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SRRTQ9BXP5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SRRTQ9BXP5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SRRTQ9BXP5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SRRTQ9BXP5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SRRTQ9BXP5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SRRTQ9BXP5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SRRTQ9BXP5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SRRTQ9BXP5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SRRTQ9BXP5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SRRTQ9BXP5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SRRTQ9BXP5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SRRTQ9BXP5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SRRTQ9BXP5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SRRTQ9BXP5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SRRTQ9BXP5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SRRTQ9BXP5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SRRTQ9BXP5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SRRTQ9BXP5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SRRTQ9BXP5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SRRTQ9BXP5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SRRTQ9BXP5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SRRTQ9BXP5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SRRTQ9BXP5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SRRTQ9BXP5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SRRTQ9BXP5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SRRTQ9BXP5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SRRTQ9BXP5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SRRTQ9BXP5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SRRTQ9BXP5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms