Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSJ2

TUBGCP2, Gamma-tubulin complex component 2, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP2Q9BSJ2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TUBGCP2Q9BSJ2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TUBGCP2Q9BSJ2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TUBGCP2Q9BSJ2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TUBGCP2Q9BSJ2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TUBGCP2Q9BSJ2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TUBGCP2Q9BSJ2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TUBGCP2Q9BSJ2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TUBGCP2Q9BSJ2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TUBGCP2Q9BSJ2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TUBGCP2Q9BSJ2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TUBGCP2Q9BSJ2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TUBGCP2Q9BSJ2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TUBGCP2Q9BSJ2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TUBGCP2Q9BSJ2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TUBGCP2Q9BSJ2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TUBGCP2Q9BSJ2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TUBGCP2Q9BSJ2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TUBGCP2Q9BSJ2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TUBGCP2Q9BSJ2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TUBGCP2Q9BSJ2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TUBGCP2Q9BSJ2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TUBGCP2Q9BSJ2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TUBGCP2Q9BSJ2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TUBGCP2Q9BSJ2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TUBGCP2Q9BSJ2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TUBGCP2Q9BSJ2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TUBGCP2Q9BSJ2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TUBGCP2Q9BSJ2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TUBGCP2Q9BSJ2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TUBGCP2Q9BSJ2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TUBGCP2Q9BSJ2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TUBGCP2Q9BSJ2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TUBGCP2Q9BSJ2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TUBGCP2Q9BSJ2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TUBGCP2Q9BSJ2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TUBGCP2Q9BSJ2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TUBGCP2Q9BSJ2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TUBGCP2Q9BSJ2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TUBGCP2Q9BSJ2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TUBGCP2Q9BSJ2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TUBGCP2Q9BSJ2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TUBGCP2Q9BSJ2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TUBGCP2Q9BSJ2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TUBGCP2Q9BSJ2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TUBGCP2Q9BSJ2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TUBGCP2Q9BSJ2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TUBGCP2Q9BSJ2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TUBGCP2Q9BSJ2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TUBGCP2Q9BSJ2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TUBGCP2Q9BSJ2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TUBGCP2Q9BSJ2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TUBGCP2Q9BSJ2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TUBGCP2Q9BSJ2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TUBGCP2Q9BSJ2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TUBGCP2Q9BSJ2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TUBGCP2Q9BSJ2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TUBGCP2Q9BSJ2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TUBGCP2Q9BSJ2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TUBGCP2Q9BSJ2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TUBGCP2Q9BSJ2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TUBGCP2Q9BSJ2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TUBGCP2Q9BSJ2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TUBGCP2Q9BSJ2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TUBGCP2Q9BSJ2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TUBGCP2Q9BSJ2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TUBGCP2Q9BSJ2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TUBGCP2Q9BSJ2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TUBGCP2Q9BSJ2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TUBGCP2Q9BSJ2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TUBGCP2Q9BSJ2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TUBGCP2Q9BSJ2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TUBGCP2Q9BSJ2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TUBGCP2Q9BSJ2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TUBGCP2Q9BSJ2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TUBGCP2Q9BSJ2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TUBGCP2Q9BSJ2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TUBGCP2Q9BSJ2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TUBGCP2Q9BSJ2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TUBGCP2Q9BSJ2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TUBGCP2Q9BSJ2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TUBGCP2Q9BSJ2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TUBGCP2Q9BSJ2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TUBGCP2Q9BSJ2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TUBGCP2Q9BSJ2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TUBGCP2Q9BSJ2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TUBGCP2Q9BSJ2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TUBGCP2Q9BSJ2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TUBGCP2Q9BSJ2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TUBGCP2Q9BSJ2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUBGCP2Q9BSJ2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TUBGCP2Q9BSJ2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUBGCP2Q9BSJ2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUBGCP2Q9BSJ2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TUBGCP2Q9BSJ2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TUBGCP2Q9BSJ2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TUBGCP2Q9BSJ2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TUBGCP2Q9BSJ2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TUBGCP2Q9BSJ2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TUBGCP2Q9BSJ2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.8 ms