Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS16

CENPK, Centromere protein K, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPKQ9BS16 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CENPKQ9BS16 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CENPKQ9BS16 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CENPKQ9BS16 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPKQ9BS16 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPKQ9BS16 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPKQ9BS16 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPKQ9BS16 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPKQ9BS16 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPKQ9BS16 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPKQ9BS16 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPKQ9BS16 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPKQ9BS16 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPKQ9BS16 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPKQ9BS16 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPKQ9BS16 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPKQ9BS16 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPKQ9BS16 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPKQ9BS16 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPKQ9BS16 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPKQ9BS16 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPKQ9BS16 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPKQ9BS16 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPKQ9BS16 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPKQ9BS16 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPKQ9BS16 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPKQ9BS16 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPKQ9BS16 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPKQ9BS16 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPKQ9BS16 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPKQ9BS16 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPKQ9BS16 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPKQ9BS16 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPKQ9BS16 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPKQ9BS16 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPKQ9BS16 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPKQ9BS16 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPKQ9BS16 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPKQ9BS16 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPKQ9BS16 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPKQ9BS16 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPKQ9BS16 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPKQ9BS16 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPKQ9BS16 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPKQ9BS16 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPKQ9BS16 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPKQ9BS16 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPKQ9BS16 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPKQ9BS16 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPKQ9BS16 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPKQ9BS16 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPKQ9BS16 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPKQ9BS16 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CENPKQ9BS16 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CENPKQ9BS16 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CENPKQ9BS16 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CENPKQ9BS16 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPKQ9BS16 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPKQ9BS16 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPKQ9BS16 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPKQ9BS16 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPKQ9BS16 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPKQ9BS16 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPKQ9BS16 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPKQ9BS16 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPKQ9BS16 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPKQ9BS16 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPKQ9BS16 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPKQ9BS16 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPKQ9BS16 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPKQ9BS16 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPKQ9BS16 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPKQ9BS16 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPKQ9BS16 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPKQ9BS16 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPKQ9BS16 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPKQ9BS16 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPKQ9BS16 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPKQ9BS16 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPKQ9BS16 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPKQ9BS16 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPKQ9BS16 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPKQ9BS16 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPKQ9BS16 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPKQ9BS16 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPKQ9BS16 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPKQ9BS16 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPKQ9BS16 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPKQ9BS16 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPKQ9BS16 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPKQ9BS16 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPKQ9BS16 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CENPKQ9BS16 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CENPKQ9BS16 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CENPKQ9BS16 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CENPKQ9BS16 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CENPKQ9BS16 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPKQ9BS16 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPKQ9BS16 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPKQ9BS16 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms