Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC39A3Q9BRY0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC39A3Q9BRY0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC39A3Q9BRY0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC39A3Q9BRY0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC39A3Q9BRY0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC39A3Q9BRY0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC39A3Q9BRY0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC39A3Q9BRY0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC39A3Q9BRY0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC39A3Q9BRY0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC39A3Q9BRY0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC39A3Q9BRY0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC39A3Q9BRY0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLC39A3Q9BRY0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLC39A3Q9BRY0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLC39A3Q9BRY0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC39A3Q9BRY0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC39A3Q9BRY0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC39A3Q9BRY0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC39A3Q9BRY0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC39A3Q9BRY0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC39A3Q9BRY0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC39A3Q9BRY0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC39A3Q9BRY0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC39A3Q9BRY0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC39A3Q9BRY0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC39A3Q9BRY0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC39A3Q9BRY0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC39A3Q9BRY0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC39A3Q9BRY0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC39A3Q9BRY0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC39A3Q9BRY0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC39A3Q9BRY0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC39A3Q9BRY0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC39A3Q9BRY0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC39A3Q9BRY0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC39A3Q9BRY0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC39A3Q9BRY0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC39A3Q9BRY0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC39A3Q9BRY0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC39A3Q9BRY0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC39A3Q9BRY0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC39A3Q9BRY0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC39A3Q9BRY0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC39A3Q9BRY0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC39A3Q9BRY0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC39A3Q9BRY0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC39A3Q9BRY0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC39A3Q9BRY0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC39A3Q9BRY0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC39A3Q9BRY0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC39A3Q9BRY0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC39A3Q9BRY0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC39A3Q9BRY0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC39A3Q9BRY0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC39A3Q9BRY0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC39A3Q9BRY0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC39A3Q9BRY0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC39A3Q9BRY0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC39A3Q9BRY0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC39A3Q9BRY0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC39A3Q9BRY0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC39A3Q9BRY0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC39A3Q9BRY0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC39A3Q9BRY0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC39A3Q9BRY0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC39A3Q9BRY0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC39A3Q9BRY0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC39A3Q9BRY0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC39A3Q9BRY0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC39A3Q9BRY0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC39A3Q9BRY0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC39A3Q9BRY0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC39A3Q9BRY0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC39A3Q9BRY0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC39A3Q9BRY0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC39A3Q9BRY0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC39A3Q9BRY0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC39A3Q9BRY0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC39A3Q9BRY0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC39A3Q9BRY0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC39A3Q9BRY0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC39A3Q9BRY0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC39A3Q9BRY0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC39A3Q9BRY0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC39A3Q9BRY0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC39A3Q9BRY0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC39A3Q9BRY0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC39A3Q9BRY0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC39A3Q9BRY0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC39A3Q9BRY0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC39A3Q9BRY0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC39A3Q9BRY0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC39A3Q9BRY0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC39A3Q9BRY0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC39A3Q9BRY0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC39A3Q9BRY0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC39A3Q9BRY0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC39A3Q9BRY0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.6 ms