Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIPSNAP1Q9BPW8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIPSNAP1Q9BPW8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NIPSNAP1Q9BPW8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NIPSNAP1Q9BPW8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NIPSNAP1Q9BPW8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NIPSNAP1Q9BPW8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NIPSNAP1Q9BPW8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NIPSNAP1Q9BPW8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NIPSNAP1Q9BPW8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NIPSNAP1Q9BPW8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NIPSNAP1Q9BPW8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NIPSNAP1Q9BPW8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NIPSNAP1Q9BPW8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NIPSNAP1Q9BPW8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NIPSNAP1Q9BPW8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NIPSNAP1Q9BPW8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NIPSNAP1Q9BPW8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NIPSNAP1Q9BPW8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NIPSNAP1Q9BPW8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NIPSNAP1Q9BPW8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NIPSNAP1Q9BPW8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NIPSNAP1Q9BPW8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NIPSNAP1Q9BPW8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NIPSNAP1Q9BPW8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NIPSNAP1Q9BPW8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NIPSNAP1Q9BPW8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NIPSNAP1Q9BPW8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NIPSNAP1Q9BPW8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NIPSNAP1Q9BPW8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NIPSNAP1Q9BPW8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NIPSNAP1Q9BPW8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NIPSNAP1Q9BPW8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NIPSNAP1Q9BPW8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NIPSNAP1Q9BPW8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NIPSNAP1Q9BPW8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NIPSNAP1Q9BPW8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NIPSNAP1Q9BPW8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NIPSNAP1Q9BPW8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NIPSNAP1Q9BPW8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NIPSNAP1Q9BPW8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NIPSNAP1Q9BPW8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NIPSNAP1Q9BPW8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NIPSNAP1Q9BPW8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NIPSNAP1Q9BPW8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NIPSNAP1Q9BPW8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NIPSNAP1Q9BPW8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NIPSNAP1Q9BPW8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NIPSNAP1Q9BPW8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NIPSNAP1Q9BPW8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NIPSNAP1Q9BPW8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NIPSNAP1Q9BPW8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NIPSNAP1Q9BPW8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NIPSNAP1Q9BPW8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NIPSNAP1Q9BPW8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NIPSNAP1Q9BPW8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NIPSNAP1Q9BPW8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NIPSNAP1Q9BPW8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NIPSNAP1Q9BPW8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NIPSNAP1Q9BPW8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NIPSNAP1Q9BPW8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NIPSNAP1Q9BPW8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NIPSNAP1Q9BPW8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NIPSNAP1Q9BPW8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NIPSNAP1Q9BPW8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NIPSNAP1Q9BPW8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NIPSNAP1Q9BPW8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NIPSNAP1Q9BPW8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NIPSNAP1Q9BPW8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NIPSNAP1Q9BPW8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NIPSNAP1Q9BPW8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NIPSNAP1Q9BPW8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NIPSNAP1Q9BPW8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NIPSNAP1Q9BPW8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NIPSNAP1Q9BPW8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NIPSNAP1Q9BPW8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NIPSNAP1Q9BPW8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NIPSNAP1Q9BPW8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NIPSNAP1Q9BPW8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NIPSNAP1Q9BPW8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NIPSNAP1Q9BPW8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NIPSNAP1Q9BPW8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NIPSNAP1Q9BPW8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NIPSNAP1Q9BPW8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NIPSNAP1Q9BPW8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NIPSNAP1Q9BPW8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NIPSNAP1Q9BPW8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NIPSNAP1Q9BPW8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NIPSNAP1Q9BPW8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NIPSNAP1Q9BPW8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NIPSNAP1Q9BPW8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NIPSNAP1Q9BPW8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NIPSNAP1Q9BPW8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NIPSNAP1Q9BPW8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NIPSNAP1Q9BPW8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NIPSNAP1Q9BPW8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1703.3 ms